Nikita

Będąc nastolatką z problemami, Nikita została ocalona z celi śmierci przez tajną amerykańską agencję znaną jako Sekcja, która wyszkoliła ją na szpiega i zabójczynię. W końcu Nikita została zdradzona przez jedyne osoby, którym ufała. Teraz, po trzech latach ukrywania się, pragnie zemsty i daje jasno do zrozumienia swojemu dawnemu szefowi, Percy'emu, oraz dawnym przyjaciołom, Michaelowi i Birkhoffowi, że nie cofnie się przed niczym, by zdemaskować i zniszczyć ich tajną operację. Sekcja nadal rekrutuje i szkoli kolejnych młodych ludzi, w tym Jaden i Thoma, zacierając wszelkie ślady ich dawnego życia i zmieniając ich w zimnych, skutecznych morderców. Jedną z nowych rekrutek jest Alex, piękna dziewczyna z brutalną przeszłością i historią bardzo podobną do losów Nikity. Wszyscy rekruci przechodzą część szkolenia pod okiem Amandy, mistrzyni manipulacji, która potrafi zmienić każde brzydkie kaczątko w łabędzia, a każdą wrażliwą duszę w bezwzględnego zabójcę.

Percy i Michael obejmują ochroną swój najnowszy cel – słowiańskiego przywódcę poszukiwanego za zbrodnie wojenne. Nikita dowiaduje się o ich kryjówce i próbuje pokrzyżować ich plany, ale ubiega ją tajemnicza grupa najemników poszukujących materiałów nuklearnych. Alex zostaje zmobilizowana wcześniej, niż przewidywano, do misji specjalnej, która rzuca ją w sam środek strzelaniny. Retrospekcja ujawnia przełomowy moment w życiu Nikity.

Nikita ratuje Jill, dziennikarkę próbującą ujawnić spisek łączący Sekcję z wielką katastrofą lotniczą. Michael i Percy podejrzewają, że to Birkhoff jest wtyczką Nikity wewnątrz agencji, i wysyłają Amandę, aby go przesłuchała. Michael prosi rekrutów – Alex, Jaden i Thoma – o pomoc w zlokalizowaniu ich kolejnego celu.

Nikita wraca myślami do przeszłości, gdy pracowała pod przykrywką jako niania u wpływowego urzędnika państwowego, i postanawia naprawić krzywdy związane z jego śmiercią. Podczas misji Michael przychodzi Nikicie z pomocą i zaczyna powątpiewać w motywy Percy'ego. W tym czasie w Sekcji, podczas szkolenia podstawowego, Alex przeżywa atak paniki, co skłania Amandę do podjęcia próby wyleczenia jej z klaustrofobii.

Tajemnice Sekcji mogą wyjść na jaw, gdy Owen, jeden z agentów, ucieka po napadzie na bank i staje się zbiegiem. Percy postanawia osobiście zająć się poszukiwaniami Owena, co wzbudza podejrzenia Michaela. Dochodzi do bezpośredniej konfrontacji Nikity i Owena, dopóki nie dołącza do nich Percy i nie rozpoczyna się nerwowy impas. Alex zakrada się do gabinetu Percy'ego, by ostrzec Nikitę, ale zostaje nakryta przez Thoma, z którym łączy ją chwila bliskości.

Autobus z rekrutami Sekcji zostaje zaatakowany przez terrorystów, którzy porywają Alex i Thoma. Oboje nie zdają sobie sprawy, że to test zorganizowany przez Sekcję. Percy, Michael i Amanda obserwują tortury, jakim poddawana jest Alex. Dziewczyna uwalnia się i kontaktuje z Nikitą z prośbą o pomoc. Tymczasem Nikita zyskuje zaufanie Owena, który przekazuje jej druzgocącą wiadomość na temat jej narzeczonego.

Alex informuje Nikitę, że jeden z rekrutów został wysłany na misję samobójczą. Nikita przechwytuje go w momencie, gdy na miejsce przybywa Michael, i dochodzi do wymiany ognia. W tym samym czasie w murach Sekcji inny rekrut atakuje strażników, wywołując powszechny chaos.

Sekcja wysyła Thoma, aby zlikwidował Annę – kobietę, która miała potajemny romans z amerykańskim senatorem. Agencja zgadza się zatrzeć wszelkie ślady romansu, pod warunkiem że senator pomoże w przegłosowaniu ustawy zapewniającej jej dalsze finansowanie. Nikita, z pomocą Alex, próbuje skontaktować się z rodzicami Anny, ale rozmowa nie przebiega po jej myśli.

Nikita i Michael tymczasowo łączą siły, aby zabić terrorystę, który wiele lat wcześniej zamordował rodzinę Michaela. Gdy Percy się o tym dowiaduje, wysyła agentów Sekcji, by zabili Nikitę, co ostatecznie naraża misję na szwank i prowadzi do schwytania Michaela przez terrorystów. Alex zostaje przyłapana na przeglądaniu kartotek medycznych w Sekcji; wymyśla więc kłamstwo wciągające w to Jaden, przez co niemal dekonspiruje samą siebie.

Owen ujawnia mediom tajne informacje z czarnych skrzynek Sekcji, dowodząc, że rząd USA stał za zamachem w Chile. W rezultacie Percy wrabia w tę zbrodnię agenta CIA, Ryana. Nikita i Owen udają się do Chile, aby odbić Ryana z rąk najemników, ale sami zostają schwytani. Nikita wyjawia Ryanowi sekrety Sekcji, próbując ocalić im wszystkim życie. Tymczasem w Sekcji Alex szpieguje Percy'ego i Birkhoffa, dostrzegając u szefa zupełnie nowe oblicze.

Alex informuje Nikitę, że Sekcja wysyła ją na pierwszą misję, której celem jest likwidacja przywódcy syndykatu zbrodni. Alex ma opory przed odebraniem komuś życia, lecz Nikita uspokaja ją i deklaruje pomoc w wykonaniu wyroku. Birkhoff powiadamia Percy'ego i Michaela o wykryciu ukrytego programu, za pomocą którego wtyczka kontaktuje się ze światem zewnętrznym i Nikitą. Gdy misja wymyka się spod kontroli, Nikita podejmuje szybką decyzję, by oczyścić Alex z podejrzeń. W Sekcji Jaden próbuje zdemaskować Alex jako kreta, ale interwencja Thoma i szokujący wypadek odsuwają od niej wszelkie podejrzenia.

Będąc już pełnoprawną agentką, Alex dostaje nowe mieszkanie i pracę pod przykrywką. Poznaje nowego sąsiada Nathana, który zaprasza ją na imprezę u siebie. Nikita ostrzega Alex przed zbytnim zbliżaniem się do ludzi, ale dziewczyna miota się między obowiązkami w Sekcji a pragnieniem normalnego życia. Nikita dowiaduje się, że Sekcja wszczepiła Alex zabójczy czip, i postanawia przejąć nad nim kontrolę. Podczas przesłuchania Birkhoffa Nikita zaskakuje Ryana, wyjawiając pewien sekret.

Pierwszym zadaniem Alex jest misja zespołowa polegająca na zabiciu księcia Gruzji podczas gali w muzeum. Gdy Alex mówi o zleceniu Nikicie, obie opracowują plan udaremnienia zamachu. Nikita ufa jednak niewłaściwej osobie, przez co ich plan pali na panewce, dochodzi do impasu, a Sekcja dowiaduje się o obecności Nikity w budynku. Percy wysyła Michaela z rozkazem zabicia jej.

Ryan przechwytuje wiadomość o niebezpiecznej, nowoczesnej broni przemycanej do USA i prosi Nikitę o pomoc w powstrzymaniu dostawy. Nikita odkrywa, że za transportem stoi Voss – mężczyzna, z którym musiała wejść w intymną relację podczas dawnej misji dla Sekcji. Z oporami powraca do swojej dawnej tożsamości, by zdobyć pocisk. W tym czasie Michael zaczyna wtrącać się w nowe życie Alex z Nathanem.

Podczas wykonywania misji dla Sekcji Alex wpada na Irinę, kobietę ze swojej przeszłości. Próbuje pomóc dawnej znajomej uwolnić się od porywacza, ta jednak ją zdradza i oddaje w ręce Vlada, rosyjskiego gangstera, z którym Alex ma dawne rachunki do wyrównania. Nikita orientuje się, że Alex grozi niebezpieczeństwo, i rusza jej na ratunek, ale natyka się na Michaela, który poszukuje swojej zaginionej agentki. Nikita, nie mogąc zdradzić tożsamości Alex, musi znaleźć sposób na współpracę z Michaelem, by ocalić przyjaciółkę.

Chcąc przyspieszyć rekonwalescencję Alex po ostatniej misji, Amanda podaje jej leki uspokajające, a następnie wykorzystuje jej stan otępienia, by wypytać ją o skrywane tajemnice. Nikita zdaje sobie sprawę z zagrożenia i próbuje załatwić dla Alex nową tożsamość, by wywieźć ją z kraju. Jednak kontakt Nikity okazuje się nielojalny, przez co staje ona twarzą w twarz z niespodziewanym przeciwnikiem. W międzyczasie Michael zaczyna podejrzewać Alex i zleca Birkhoffowi jej prześwietlenie.

Michael konfrontuje się z Nikitą w jej kryjówce i ujawnia, że wie, iż to Alex jest wtyczką. Daje Nikicie 24 godziny na odnalezienie Kasima, człowieka, który zabił jego rodzinę, grożąc, że w przeciwnym razie wyda Alex Percy'emu.

Owen wraca z informacjami o jednej z czarnych skrzynek Percy'ego. Nikita jedzie z nim do Londynu, aby ją odzyskać, ale zauważa, że mężczyzna zachowuje się dziwnie. Owen oświadcza, że chce opublikować zawartość skrzynki, a gdy Nikita się sprzeciwia, zwraca się przeciwko niej. Tymczasem Percy dowiaduje się o pobycie Nikity w Londynie i wysyła Michaela, by ją zabił. Ponadto Amanda podsłuchuje kłótnię Jaden z Alex na temat tuneli ewakuacyjnych i podłącza Alex do wykrywacza kłamstw, by raz na zawsze poznać prawdę.

Nikita uznaje, że pobyt Alex w Sekcji staje się zbyt niebezpieczny i czas, by dziewczyna zniknęła. Alex się zgadza, lecz zanim plan wejdzie w życie, wraz z Jaden dostają zagraniczną misję powstrzymania syna zagranicznego prezydenta (gościnnie Edi Gathegi) przed sprzedażą nowo opracowanej toksyny paraliżującej układ nerwowy. Sytuacja wymyka się spod kontroli, a Alex musi wybierać między powodzeniem misji a ratowaniem własnego życia.

Sfrustrowany tym, że Nikita przechwytuje kolejne czarne skrzynki, Percy wysyła Michaela, by sprawdził jedną z nich oraz pilnującego jej strażnika. Nikita dociera do małego miasteczka w Pensylwanii jako pierwsza i z zaskoczeniem odkrywa, że strażniczką jest zwykła kobieta o imieniu Dana, która porzuciła posterunek i próbuje wieść normalne życie z mężem i dzieckiem. Napięcie rośnie, gdy Michael jest zmuszony zameldować o jej nielojalności, a Sekcja wysyła ekipę, by zatrzeć wszelkie ślady jej istnienia. W tym samym czasie Alex i Jaden wdają się w kłótnię, w którą wplątany zostaje Nathan.

Gdy Michael dowiaduje się, że Percy nakazał Sekcji zlikwidować wszystkich, którzy mogliby odszyfrować czarne skrzynki, wysyła Nikitę na ratunek ostatniej osobie z listy – kryptografowi CIA nazwiskiem Malcolm. Nikita porywa Malcolma i oddaje go pod opiekę Ryana. Tymczasem Percy zwraca się przeciwko Alex.

W trzymającym w napięciu finale sezonu Percy podejmuje próbę przejęcia kontroli nad CIA, Alex zaczyna działać na własną rękę, a Michael zostaje uwięziony w Sekcji, przez co nie może pomóc Nikicie, której za udzieloną pomoc może przyjść zapłacić najwyższą cenę.

Nikita i Michael planują zniszczenie Sekcji oraz Nadzoru i zamierzają wykorzystać do tego zawartość czarnej skrzynki. Na czele Sekcji stoi teraz Amanda, lecz Nadzór przydziela jej do pomocy własnego człowieka, nowego agenta Seana (Dillon Casey), który ma mieć na nią oko. Pierwszym zadaniem Amandy jest odzyskanie czarnej skrzynki od Nikity, do czego angażuje Alex. Dziewczyna odmawia do momentu, gdy Amanda obiecuje pomóc jej odnaleźć zabójcę jej ojca. Tymczasem Nikita i Michael otrzymują wsparcie od niespodziewanego sojusznika.

Badając sprawę dawnego, nielegalnego programu Sekcji o nazwie P9, który najwyraźniej znów wznowiono, Nikita i Michael natrafiają na Owena. Mężczyzna mówi im, że poszukuje doktora Josepha Marsa – nie tylko twórcy P9, lecz także wynalazcy Regimenu, który mógłby pomóc Owenowi uwolnić się od uzależnienia od tego niebezpiecznego leku. Michael nieufnie podchodzi do Owena, ale Nikita decyduje, że cała trójka powinna połączyć siły. Percy żąda widzenia z Alex.

Birkhoff informuje Nikitę i Michaela, że pliki z czarnej skrzynki ujawniają, iż Ramon – międzynarodowy terrorysta przypisujący sobie głośne zamachy polityczne – pracuje teraz dla Sekcji. Ta wiadomość wstrząsa Nikitą, ponieważ to ona lata temu schwytała Ramona i przekazała go Percy'emu. Amanda nakłania Alex do zabicia Antona Kochenki, dawnego pracownika jej ojca, planując zrzucić winę na Ramona. Jednak gdy Nikita krzyżuje jej plany, Amanda bierze odwet, uderzając w to, co dla Nikity najcenniejsze.

Nikita jest w szoku, gdy dowiaduje się, że jej dawna partnerka z Sekcji, Kelly, uciekła z tureckiego więzienia. Nikita myślała, że Kelly zginęła wiele lat temu, i zawsze czuła się za to odpowiedzialna, ponieważ doszło do tego podczas misji, w trakcie której Nikita uciekła z Sekcji. Wiedząc, że Amanda ruszy w ślad za Kelly, Nikita mówi Michaelowi, że muszą polecieć do Turcji, aby jej pomóc. Amanda wysyła Alex i Roana do Europy, by nie dopuścili do spotkania byłych partnerek.

Michael odkrywa, że Cassandra, kobieta, z którą niegdyś romansował na polecenie Sekcji, znalazła się w niebezpieczeństwie. Dręczony poczuciem winy z powodu tego, jak zakończyła się ich relacja, chce jej pomóc, ale Nikita podejrzewa, że nie chodzi mu tylko o uspokojenie sumienia. Amanda manipuluje Alex, by ta pomogła jej w misji, lecz Sean wplątuje się w sieć kłamstw Amandy i zaczyna wątpić w prawdziwe motywy Sekcji.

Szukając informacji na temat czarnej skrzynki, Birkhoff trafia na akt urodzenia Nikity. Nikita i Michael odnajdują jej ojca, Richarda, jednak spotkanie po latach nie przebiega tak, jak Nikita się spodziewała. Percy mówi Alex, że czarna skrzynka znajdująca się w rękach Nikity zawiera informacje, które mogą pomóc jej pomścić śmierć ojca.

Podczas pobytu w więzieniu Ryan odkrywa schematy ujawniające, w jaki sposób Nadzór zdobywa fundusze. Ryan aranżuje spotkanie z Nikitą, by przekazać jej szczegóły, lecz Amanda przechwytuje ich szyfrowane wiadomości i alarmuje Nadzór, który wysyła swojego człowieka do przesłuchania Ryana. Nikita i Michael robią wszystko, by wyciągnąć Noaha z więzienia, zanim dopadnie go Nadzór. W międzyczasie Alex jest śledzona przez Gogola i staje twarzą w twarz z kimś ze swojej przeszłości.

Michael wpada w panikę na wieść o tym, że Cassandra ma kłopoty, i spieszy jej na pomoc. Odkrywa, że generał Tupelov oskarżył ją o kradzież dwóch milionów dolarów i grozi jej śmiercią, jeśli ich nie odda. Kiedy jednak wersja wydarzeń Cassandry budzi wątpliwości, Nikita zaczyna podejrzewać, że kobieta może coś ukrywać. Tymczasem Alex otrzymuje od Percy'ego niezwykle kuszącą propozycję, która może dać jej środki na eliminację wroga.

Nikita kradnie fundusze Nadzoru, zmuszając jego członków do zwołania nadzwyczajnego posiedzenia. Nikita i Birkhoff znajdują sposób na podsłuchanie zebrania, by Nikita mogła zidentyfikować pozostałych członków Nadzoru, lecz plany biorą w łeb i Sean chwyta Birkhoffa. Amanda żąda informacji o kryjówce Nikity, lecz Birkhoff odmawia wydania przyjaciółki, więc Amanda zaczyna go torturować. W tym samym czasie Alex wciela w życie plan odzyskania imperium swojego ojca. Ponieważ za jej głowę wyznaczono nagrodę, Alex zdaje sobie sprawę, że najłatwiej dostanie się do Rosji tą samą drogą, którą została z niej wywieziona – poprzez nielegalną siatkę handlu żywym towarem.

Pod nieobecność Michaela Nikita zwraca się do Owena o pomoc w namierzeniu i kradzieży kolejnej czarnej skrzynki od Strażnika. Niestety odkrywa, że Owen pracuje dla kogoś bardzo niespodziewanego, co może zagrozić całej operacji Nikity. Amanda zdaje sobie sprawę, że Alex otrzymała poufne informacje o Semaku, a te mogły pochodzić wyłącznie od Percy'ego. Wściekła, że Percy podważa jej autorytet, Amanda pozbawia go wszelkich wygód. Z powrotem w Rosji Alex wykonuje wreszcie swój ruch.

Misja Alex mająca na celu zniszczenie Gogola wkracza w decydującą fazę, gdy dziewczyna infiltruje swój dom rodzinny i staje oko w oko z duchami przeszłości. Prowadząc zupełnie odrębną misję, Nikita również pojawia się w rezydencji, aby ukraść czarną skrzynkę Semaka. Nikita i Alex wpadają na siebie i postanawiają połączyć siły, ale natrafiają na poważną przeszkodę. W tym czasie Michael i Owen współpracują, aby odkryć sekretny plan Percy'ego i Strażników.

Sean atakuje Nikitę i Michaela, próbując chronić swoją matkę. Tymczasem Percy zyskuje przewagę nad Amandą i grozi zrównaniem Sekcji z ziemią, jeśli ta go nie wypuści.

Percy każe swoim Strażnikom przetrzymywać członków Nadzoru jako zakładników, dopóki Amanda nie spełni jego żądań. Jeśli tego nie zrobi, Strażnicy zastrzelą wszystkich członków Nadzoru i wypuszczą w Sekcji śmiertelny gaz, który natychmiast zabije wszystkich, w tym Amandę. Nikita bije się z myślami między pozwoleniem na upadek wroga a ratowaniem niewinnych istnień w Sekcji. Tymczasem zdesperowany Sean próbuje wyrwać matkę ze szponów Percy'ego i prosi o pomoc Nikitę, Michaela i Alex.

Percy kontynuuje realizację planu odzyskania Sekcji, grożąc zabiciem mentorki Nikity, Carli – kobiety, która ściągnęła Nikitę z ulicy, gdy ta była narkomanką. Zdeterminowana, by dotrzeć do Carli przed Percym, Nikita wykorzystuje Madeline do przekazania wiadomości. Percy przechwytuje wiadomość i rozpoczyna się wyścig z czasem, kto pierwszy dotrze do Carli. W międzyczasie Amanda mówi Alex, że nadszedł czas, by odzyskała Zetrov i ogłosiła światu, że Aleksandra Udinow żyje.

Nikita i Michael próbują pomóc Carli przypomnieć sobie przeszłość, która kryje klucz do zniszczenia Sekcji. Carla opowiada o nocy, w której Nikita została aresztowana, a to, czego Nikita się dowiaduje, zwala ją z nóg. W międzyczasie Alex pojawia się na konferencji prasowej Zetrova, gdzie przemawia Semak, i ogłasza, że jest Aleksandrą Udinow. Alex żąda wymiany: matka za imperium.

W Sekcji panuje poruszenie, ponieważ jej agenci są eliminowani jeden po drugim. Amanda uświadamia sobie, że za zabójstwami stoi Percy, który próbuje podważyć jej autorytet wśród innych agentów Sekcji. Niechętnie dzwoni do Nikity z propozycją nie do odrzucenia: zatrzymaj Percy'ego, a oddam ci Ryana.

Michael wpada we wściekłość, gdy odkrywa sekret, który ukrywała przed nim Cassandra. Wraz z Nikitą leci do Moskwy, by z nią porozmawiać. Tymczasem Alex podejmuje ostatnią rozpaczliwą próbę odnalezienia matki (gościnnie Sarah Clarke), wysyłając zaszyfrowaną wiadomość podczas wywiadu telewizyjnego.

Amanda i Ari organizują posiedzenie zarządu firmy Zetrov i przygotowują się do przejęcia kontroli nad spółką. Po burzliwej konfrontacji twarzą w twarz z Amandą Nikita wspomina, jaka Amanda była, gdy po raz pierwszy trafiła do Sekcji. Tymczasem Alex zaskakuje Ariego, pojawiając się na posiedzeniu zarządu ze starym, wpływowym przyjacielem.

Kiedy Nikita pracowała dla Sekcji, jej celem był mężczyzna o nazwisku Nicholas Brandt, w którego najbliższe otoczenie udało jej się przeniknąć. Schwytała go i od tamtej pory Brandt siedział za kratkami. Percy pomaga mu jednak uciec, a jego pierwszym celem staje się schwytanie Nikity w ramach zemsty. Gdy wpada ona w jego ręce, Brandt zaczyna ją torturować, zmuszając Nikitę do skonfrontowania się z tą częścią jej samej, którą uważała za dawno pogrzebaną. W międzyczasie Percy dalej pogrywa psychologicznie z Michaelem, Alex i Seanem, doprowadzając jedno z nich na skraj śmierci.

Nikita przekonuje niechętnego Birkhoffa, by przeznaczył 20 milionów dolarów z własnych pieniędzy na plan doprowadzenia Percy'ego i Sekcji do bankructwa. Gdy jednak Percy kradnie całe oszczędności życia Birkhoffa, dochodzi do spięcia między nim a Nikitą. Zespół Nikity ma ostatnią szansę, by ponownie uderzyć w Percy'ego, lecz Birkhoff zostaje aresztowany przy próbie odzyskania milionów. Nikita zdaje sobie sprawę, że musi wyciągnąć go z aresztu, zanim dopadnie go Sekcja. Michael i Alex ruszają w pościg za skradzionymi pieniędzmi Birkhoffa, a Nikita wyrusza na ratunek.

Gdy plany Percy'ego dotyczące broni jądrowej zaczynają wymykać się spod kontroli, Ryan sugeruje, by zwrócić się o pomoc do dyrektora CIA, Morgana Kendricka. Nikita jest temu stanowczo przeciwna i nie kryje zaskoczenia, gdy Michael staje po stronie Ryana. Napięcie rośnie, gdy okazuje się, że Nikita miała rację – wychodzi na jaw, że Kendrick jest powiązany z Percym. W międzyczasie Sean zostaje postrzelony przez ludzi Percy'ego, co głęboko wstrząsa Alex.

Percy kontaktuje się z prezydentem Stanów Zjednoczonych i grozi wybuchem nuklearnym, jeśli jego żądania nie zostaną spełnione. Birkhoff znajduje dwóch naukowców, którzy mogliby pomóc w unieszkodliwieniu nowego satelity nuklearnego Percy'ego, więc Nikita i Michael ruszają za jednym, a Sean i Alex szukają drugiego. Niestety Alex i Sean zostają uwięzieni dokładnie w miejscu, które Percy wysadza w powietrze na pokaz swojej potęgi. W międzyczasie Nikita dochodzi do wniosku, że najlepszym sposobem na powstrzymanie Percy'ego jest wejście prosto do jaskini lwa – samej Sekcji.

Nikita i Michael wdzierają się do Sekcji, by pojmać Percy'ego. Alex i Sean zostają uwięzieni w krzyżowym, śmiertelnym ogniu marines, a Ryan musi przekonać prezydenta Stanów Zjednoczonych, by nie niszczył Sekcji, dopóki nie upewni się, że Nikita i Michael są bezpieczni poza budynkiem – prezydent pragnie jednak jak najszybciej zakończyć rządy Percy'ego. W tym czasie Birkhoff prosi Sonyę o pomoc, a Nikita osacza Percy'ego w jego gabinecie, lecz ten wyciąga ostatniego asa z rękawa, co może kosztować ją zwycięstwo.

Ryan staje na czele Sekcji z Nikitą u boku. Ich pierwszą misją pod nowymi rządami jest ujęcie „Brudnej Trzydziestki” – zbuntowanych agentów, którzy nie odpowiedzieli na wezwanie do powrotu do bazy po śmierci Percy'ego. Niestety akcja nie idzie zgodnie z planem i Michael zostaje aresztowany, co zmusza Nikitę do zmiany strategii i uknucia planu jego ucieczki. Alex powraca do swojego alter ego, rozpuszczonej rosyjskiej księżniczki Aleksandry Udinow, robiąc to w wyjątkowy sposób w ramach planu odbicia Michaela. Tymczasem Birkhoff z trudem stara się utrzymać profesjonalne relacje z Sonyą, mimo rosnącej chemii między nimi.

Nikita, Michael i zespół odbijają młodą dziewczynę o imieniu Liza, przetrzymywaną przez zbuntowanego agenta Sekcji, Wade'a. Wade wyprał dziewczynie mózg i wyszkolił ją na agentkę, by pomogła mu w jego własnej misji. Nikita desperacko próbuje dotrzeć do Lizy, lecz w zamieszaniu dziewczyna ucieka z Sekcji. Zespół ściga się z czasem, by ją odnaleźć, zanim odpali bombę na wyznaczonym przez Wade'a ważnym celu. Porwanie Lizy przywołuje u Alex bolesne wspomnienia.

Gdy Ryan informuje Nikitę, że tajna agentka została aresztowana i trzeba ją wyciągnąć z więzienia, Nikita zaczyna się zastanawiać, dlaczego Sekcja wciąż realizuje dawne misje Percy'ego. Nikita, Michael i Sean próbują powstrzymać atak terrorystyczny, ale tracą jednego człowieka, gdy Alex zostaje postrzelona. Tymczasem Birkhoff i Sonia wciąż się kłócą.

Amanda wysyła zbuntowaną agentkę Sekcji, Anne, aby wyciągnęła Owena z rosyjskiego więzienia, jednak Owenowi udaje się wyrwać z jej rąk i przekazuje Nikicie wiadomość, że jest na wolności. Gdy Nikita go odnajduje, Owen jest w szoku na wieść, że ona pracuje teraz dla Sekcji, ale wraca z nią do bazy. Michael i Ryan nie są pewni, czy mogą ufać Owenowi, lecz Nikita murem stoi za przyjacielem.

Sekcja odkrywa, że jeden z ich zbuntowanych agentów, Markov, który od sześciu lat działał pod przykrywką, został wybrany na prezydenta Uzbekistanu i planuje zamach na prezydent Stanów Zjednoczonych. Ryan wyznaje zespołowi, że Sekcja stąpa po cienkim lodzie, a prezydent zagroziła ich likwidacją, jeśli opinia publiczna dowie się o istnieniu agencji i zbuntowanych agentach. Nikita i Michael są wściekli, że Ryan to przed nimi zataił, i muszą znaleźć sposób, by uratować życie prezydent, nie zdradzając przed nią zagrożenia. Tymczasem Alex i Owen cudem uchodzą z życiem z wybuchu i po zbadaniu sprawy dochodzą do wniosku, że za zamachem stoi ktoś z wewnątrz.

Nikita i Michael chwytają Cyrusa, handlarza bronią, który kupuje dla Ariego urządzenie zakłócające broń. Nikita przekonuje Ryana, by wykorzystali Cyrusa jako przynętę na Amandę, jednak mężczyźnie udaje się uciec z pułapki. Kiedy Amanda go zdradza, jedyną szansą Cyrusa na przeżycie staje się Nikita. W międzyczasie Birkhoff depcze po piętach wtyczce Amandy, a Alex zaczyna tracić panowanie nad sobą.

Birkhoff wyjawia Nikicie, że wtyczką Amandy jest Sonya. Amanda nie tylko reaktywowała jej chip uśmiercający, ale umieściła też w Sekcji drugiego kreta, by ją pilnował. Nikita, Michael i Ryan obmyślają plan wykorzystania Sonyi do namierzenia kryjówki Amandy, a Birkhoff zastawia pułapkę na drugiego szpiega. W tym czasie Michael konfrontuje Alex w sprawie jej problemów z narkotykami, a ona błaga go o dyskrecję.

Nikita i Owen mierzą się ze zbuntowanym „sprzątaczem” o imieniu Liam, podczas gdy Michael obejmuje nowe stanowisko w Sekcji. Relacja Michaela i Nikity staje się napięta, gdy ten obserwuje jej współpracę z Owenem.

Zbuntowany agent Ray porywa swoją dziewczynę Kate, więc Ryan wysyła zespół na ratunek. Nikita jest zbita z tropu, kiedy Michael zamiast wyruszyć z nią osobiście, przydziela jej do akcji Owena. Tymczasem Sean podejmuje decyzję dotyczącą Alex.

Michael rezygnuje z pracy w terenie i wraca do zarządzania operacjami wewnątrz Sekcji. Po zdobyciu kluczowych informacji od Birkhoffa Nikita przygotowuje tajną misję, która zaprowadzi ją w niebezpieczny rejon. Gdy dowiadują się o tym Michael, Alex i Ryan, ruszają za nią do Kosowa, lecz cała akcja pociąga za sobą daleko idące konsekwencje.

Agentka CIA Naomi trafia na akta ujawniające powiązania Madeline Pierce z Sekcją i przekazuje je dyrektorowi CIA, Morganowi Kendrickowi. Kiedy Kendrick wkrótce potem ginie, Amanda wrabia w zamach Seana, a CIA aresztuje go. Nikita obiecuje Alex uwolnienie Seana i opracowuje plan, który może go uratować albo kosztować życie.

Gdy Birkhoff dostaje od Shadowbota cynk, że Ari jest w Nowym Jorku, Nikita i Owen ruszają, by zgarnąć go przed FBI. Okazuje się jednak, że Ari zaplanował wszystko, by porozmawiać z Nikitą. Mówi jej, że Amanda posunęła się za daleko i współpracuje z terrorystą planującym atak na terenie USA. Ari żąda pięćdziesięciu milionów dolarów za informacje, które pozwolą schwytać zamachowca, Petera Mareka. Nikita i Michael są w szoku, gdy Ryan rozważa zapłacenie okupu. Tymczasem Sean jest zazdrosny o relację Alex i Owena.

Chcąc zdobyć czarną skrzynkę, Amanda planuje porwać syna Ariego, Stefana, by posłużył jej za kartę przetargową. Ari, wciąż przebywający pod ochroną Sekcji, błaga Nikitę o pomoc. Jednak ochroniarz Stefana, Krieg, pojmuje zarówno Nikitę, jak i Amandę, zmuszając obie kobiety do współpracy przy ucieczce. Owen jest wściekły na Michaela, gdy ten na wsparcie Nikity wyznacza Alex zamiast niego.

Amanda bierze Alex jako zakładniczkę i żąda od Nikity wydania Ariego w zamian za jej wolność. Michael wyznacza Nikitę i Seana do przeprowadzenia wymiany, jednak Ryan w ostatniej chwili dołącza do zespołu Owena, co wzbudza podejrzenia Michaela. W niewoli Alex zaprzyjaźnia się ze współwięźniarką Larissą i poprzysięga, że uwolni je obie, co ostatecznie koliduje z planem Nikity i zmusza Alex do trudnego wyboru.

Gdy Nikita decyduje, że Sekcja powinna przyjąć rządowe zlecenie na likwidację prezydenta Czadu podczas jego pobytu w Paryżu, Alex sprzeciwia się i odmawia udziału. Rozgoryczona tym, że Nikita trzyma wszystko w tajemnicy – zupełnie jak Percy – Alex angażuje Birkhoffa do wykopania haków na Danfortha, by mieć zabezpieczenie w kontaktach z rządem. Oboje przeżywają szok, gdy trafiają na sekret, który może dosłownie wysadzić Sekcję w powietrze.

Nikita i Michael dowiadują się o nowej protezie dłoni, która mogłaby przywrócić Michaelowi dawną sprawność, jednak jej cena jest niezwykle wysoka. W międzyczasie Alex i Sean mają za zadanie zbadać, kto w Sekcji stoi za krwawym buntem.

Alex zwierza się Birkhoffowi z zamiaru opuszczenia Sekcji, podczas gdy Amanda zaczyna dostarczać Owenowi to, czego nigdy nie potrafił odnaleźć – wspomnienia o jego prawdziwej przeszłości. Mimo prób pomocy ze strony Nikity, Owen zaczyna mierzyć się z wydarzeniami ze swojej przeszłości.

Unieruchomiona i odurzona Nikita zostaje poddana potwornemu procesowi prania mózgu przez Amandę, co zsyła na nią koszmarne wspomnienia. W trakcie tych tortur Nikita odkrywa najgłębiej skrywany sekret swojej oprawczyni. Alex, ujawniona jako przywódczyni buntu, próbuje wszystkich ratować, podczas gdy sytuacja gwałtownie eskaluje. Gdy Michael zostaje uwięziony przez spiskowców z Sekcji, Birkhoff i Sean muszą wkroczyć do akcji, by ocalić ukochane kobiety. Tymczasem odzyskane wspomnienia popychają Owena do niepokojących czynów podczas blokady Sekcji.

Załamana manipulacjami Amandy, niemożnością ocalenia wszystkich oraz winą za tragiczne wydarzenia w Sekcji, Alex wraca do dawnych nawyków i brutalnie daje upust emocjom. Gdy większość towarzyszy nie żyje, leży w rozsypce lub rozpierzchła się po świecie, Nikita i Michael muszą przeszukać zgliszcza Sekcji, by sprawdzić, kogo i co da się uratować – i to szybko, zanim prezydent zda sobie sprawę ze skali zniszczeń. Wspomnienia dawnych dni świetności Sekcji nie dają im spokoju, a Birkhoff mierzy się z osobistą stratą.

Wydobyta ze zgliszcz Sekcji czarna skrzynka trafia w ręce zbuntowanego agenta sterowanego przez Amandę. Kontrolowane przecieki mające podbić jej cenę natychmiast sprowadzają niebezpieczeństwo na niedobitki zespołu ze strony zagranicznych kupców i prezydenta. Bez zaplecza, z nikłymi tropami i uciekającym czasem powraca handlarz bronią Cyrus, by odkupić winy. Z jego pomocą Nikita, Michael i Alex organizują brawurową akcję na pilnie strzeżonym szczycie gospodarczym G20, by odzyskać kontrolę nad skrzynką i swoją przyszłością.

Zanim doszło do zaręczyn, Nikita mawiała: „Zawsze będzie jakaś kolejna misja”. Teraz, po ledwie przeżytych traumatycznych wydarzeniach, Michael zaczyna wątpić, czy jego narzeczona potrafi żyć poza pajęczyną kłamstw, zdrad i morderstw Sekcji – i nie on jeden ma wątpliwości. Nieustanne zagrożenie ze strony Amandy wciąż wisi nad zespołem, zwłaszcza że sprzymierzyła się ona z nowymi, tajemniczymi partnerami dysponującymi przerażającą bronią. Tymczasem Alex rozważa intrygującą propozycję od laureatki Nagrody Nobla, którą ochrania.

Amanda stawia Nikitę w śmiertelnej pułapce, zmuszając ją do wyboru między ocaleniem Michaela a ratowaniem siebie. Zespół ściga się z czasem, by powstrzymać Amandę, lecz w osłabionym składzie Sekcja może wreszcie nie sprostać przeważającym siłom wroga.

Nikita wciąż się ukrywa po tym, jak wrobiono ją w zamach na prezydenta USA. Dale, reporter stacji informacyjnej ENN, zaczyna drążyć, co tak naprawdę wydarzyło się tamtej nocy. Nikita widzi w tym szansę na oczyszczenie z zarzutów i wraca do kraju, by z nim porozmawiać, lecz wpada prosto w pułapkę Amandy. Zespół zostaje zaalarmowany, a Michael wyrusza, by odnaleźć Nikitę, zanim zrobi to wróg. Podczas gdy Birkhoff i Ryan wspierają Michaela ze swojej nowej bazy na pokładzie ultranowoczesnego samolotu, Alex obserwuje siatkę handlarzy ludźmi i odkrywa, że zamieszany jest w to Sklep. Sprawy wymykają się spod kontroli, a na miejscu niespodziewanie zjawia się Owen/Sam.

Nikita dołącza do Michaela, Birkhoffa i Ryana na pokładzie latającego centrum dowodzenia. Michael odmawia rozmów o ich relacji, ale przekonuje Nikitę, by została z nimi i pozwoliła sobie pomóc w oczyszczeniu z zarzutów. Ryan uświadamia sobie, że Amanda z pomocą Sklepu tworzy sobowtóry wpływowych osób. Nikita odkrywa, że jednym z nich jest dyrektor FBI, lecz nie wie, jak go wyeliminować bez dekonspiracji. W tym czasie Alex celuje z broni do Sama, żądając zwrotu skradzionych rzeczy, jednak atak zbirów zmusza ich do wspólnej walki o przetrwanie.

Napięcie między Stanami Zjednoczonymi a Pakistanem rośnie, po tym jak Amanda podrzuca fałszywe dowody sugerujące, że to Pakistan zlecił Nikicie zabójstwo prezydenta. Ryan nabiera podejrzeń wobec coraz dziwniejszego zachowania Birkhoffa i sugeruje Nikicie i Michaelowi, że Amanda mogła go porwać i podmienić na sobowtóra. Urzędnik NSA, Ronald Peller, zachodzi Birkhoffowi za skórę. W międzyczasie CIA zatrzymuje Alex i przesłuchuje ją w sprawie jej relacji z Nikitą.

Jones odsuwa Amandę i przejmuje stery operacji. Dzwoni do Nikity i oferuje całemu zespołowi całkowitą wolność – wyczyszczenie tożsamości i sfingowanie śmierci – w zamian za porzucenie misji. Drużyna ląduje na ustronnym pasie startowym w Pakistanie, lecz gdy samolot szturmuje lokalny boss narkotykowy z ludźmi, żądając dziesięciu milionów dolarów, Nikita prosi Alex o pieniądze. Gdy Alex wyciąga diamenty ze skrytki depozytowej, by opłacić rebeliantów, Sam dostrzega szansę na odrobienie strat i rozważa ich kradzież. W tym czasie Michael staje twarzą w twarz z dawnym rywalem, Ramonem, który uderza w niego bolesną prawdą.

Gdy Nikita wreszcie zaczyna dostrzegać koniec długiej wojny ze Sklepem, Ryan wyznaje tajemnicę, która może wszystko zniszczyć. Tymczasem Michael próbuje przekonać Nikitę do zaakceptowania nowej rzeczywistości, zastanawiając się nad ich wspólną przyszłością. Alex, zdając sobie sprawę, że Sam planował ukraść jej diamenty, wręcza mu walizkę fałszywek do przekazania kontaktowi we Francji. Jest zaskoczona, gdy ten dotrzymuje umowy i nie ucieka z klejnotami. Sprawy się jednak komplikują, gdy Sama dopada lichwiarz, u którego ma długi, a Alex musi wkroczyć, by go ratować.

Sfrustrowana tym, że konsorcjum MDK wciąż funkcjonuje, Nikita postanawia zakończyć sprawę po swojemu. Zostawia Michaela i resztę zespołu, po czym rusza z Alex, by dokonać zemsty. Obie chwytają Jonesa i zmuszają go do wyjawienia nazwisk pozostałych członków MDK. Uzbrojona w te informacje Nikita wkracza na mroczną ścieżkę, która może ją kosztować duszę. Michael namierza ją i musi nakłonić do poddania się, zanim wojsko otworzy ogień. Jednak Nikita nie zamierza się poddawać i podejmuje szokującą decyzję.