X-Men

Jubilee atakują roboty Sentinele w centrum, ale ratują ją Storm i zabierają do X-Mansion. Grupa Programu Rejestracji Mutantów zamierza tropić i eliminować mutantów. X-Meni odnajdują bazę Sentineli i chcą zniszczyć akta mutantów. Odcinek kończy się cliffhangerem, gdy Storm otwiera drzwi do pomieszczenia, gdzie żołnierze robią zasadzkę na X-Menów.

Wolverine wyczuwa olej z broni żołnierzy i szybko zamyka drzwi, zanim ci zdążą wystrzelić. Storm zmiata strażników swoją siłą wiatru. Po zniszczeniu akt dotyczących mutantów X-Men uciekają do Blackbirda, ale zostają zatrzymani przez Sentinele. Podczas walki z Sentinelami Morph zostaje postrzelony i uznany za zmarłego. Podczas gdy Beast zostaje uderzony w ogrodzenie, porażony prądem i schwytany, reszta na rozkaz Cyclopsa wycofuje się do Blackbirda. Jubilee decyduje, że najlepiej będzie zostać w X-Mansion.

Po procesie Beasta, Sabretooth żąda uwolnienia go, co powoduje, że strażnicy strzelają do Sabretootha i ranią go. Cyclops pomaga Sabretoothowi i przenosi go do ambulatorium Mansions. Później Magneto atakuje wojskowy ośrodek rakietowy. Gdy X-Meni przybywają na miejsce, Magneto przygotowuje się do wystrzelenia pocisków nuklearnych, aby doprowadzić do wojny między mutantami a ludźmi. Cyclops, Storm i Wolverine ścierają się z Magneto, ale nie są w stanie go powstrzymać. Później Storm wykorzystuje swój wiatr i błyskawice, aby spowodować zwarcie w pociskach, dezaktywując je i zrzucając do wody. Zapobiegłszy wojnie nuklearnej, X-Meni wracają do rezydencji, poznając pełną moc Magneto.

Magneto niszczy fabrykę chemiczną, aby przyciągnąć Profesora X. Cyclops, Rogue, Storm i Profesor X udają się do fabryki chemicznej, podczas gdy Jubilee zostaje, aby pilnować Sabretootha. Profesor X wchodzi do zakładu chemicznego, aby zmierzyć się z Magneto. W momencie, gdy Magneto wydaje się pokonywać Profesora X, Profesor X telepatycznie zmusza Magneto do przypomnienia sobie swoich młodych lat. Magneto wycofuje się w popłochu. W X-Mansion Sabretooth warczy z obrzydzeniem na senatora w telewizji, a Jubilee zauważa problem z jego wiązaniami na nadgarstkach. Jubilee rozluźnia więzy i Sabretooth chwyta Jubilee, lecz Wolverine wyskakuje z cienia i atakuje go. Ich walkę przerywa powrót Profesora X i pozostałych X-Men.

Grupa mutantów zwanych Morlokami porywa Jean i Cyclopsa, gdy ci wychodzą z domu. Przywódczyni Morloków, Callisto, porwała Cyclopsa, aby ten rządził Morlokami u jej boku. Jean używa swoich telepatycznych mocy i mówi profesorowi, że zostali schwytani. Wolverine, Gambit, Rogue i Storm wyruszają na ich poszukiwanie. Gdy X-Men odnajdują Jean i Cyclopsa, Storm wyzywa Callisto na przywódczynię Morlocków, aby ocaliła Cyclopsa i Jean. Callisto nie ma innego wyboru, jak tylko przyjąć wyzwanie. Po krótkiej walce Storm pokonuje Callisto i staje się nową przywódczynią Morlocków, ale po uratowaniu Jean i Cyclopsa czyni Callisto przywódczynią pod swoją nieobecność.

Wolverine ucieka do Kanady, by szukać odosobnienia na kanadyjskim pustkowiu. Odnajduje spokój wśród grupy Inuitów z Wyspy Baffina, ale odkrywa, że Sabertooth prześladuje go, a także bierze do niewoli mieszkańców wioski i planuje ich wszystkich zabić. Wolverine'owi udaje się pokonać Sabertootha i uratować mieszkańców wioski. W rezydencji X-Men Gambit mówi X-Men, że słyszał, iż mieszkańcy Genoshy chętnie przyjmują mutantów i chciałby, aby drużyna spędzała tam wakacje. Profesor Xavier wysyła Storm, Gambita i Jubilee do Genoshy jako turystów. Podczas pobytu w Genoshy Storm, Gambit i Jubilee zostają zaatakowani i schwytani przez Sentinela.

Gambit, Storm, Jubilee i wielu innych mutantów zostaje zmuszonych do pracy jako niewolnicy w Genoshy, aby dokończyć budowę tamy, która ma zasilić fabrykę Sentineli. Specjalne obroże na szyjach mutantów uniemożliwiają im używanie swoich mocy, ale Gambitowi udaje się uciec. Podczas ucieczki Gambit odnajduje Cable'a, który poszukuje osoby odpowiedzialnej za zniewolenie mutantów. Cable daje Gambitowi klucz do odblokowania obroży, po czym atakuje fabrykę Sentineli. Tymczasem Gambit uwalnia pozostałych mutantów. Mutanci rozpoczynają walkę ze strażnikami i Sentinelami, po czym uciekają. Storm wykorzystuje swoje moce, by zburzyć tamę, powodując powódź, która niszczy całą fabrykę Sentineli. X-Men wracają do domu, do zniszczonej posiadłości.

Po tym, jak X-Men odkrywają, że posiadłość została zniszczona, Wolverine wyrusza na poszukiwanie podejrzanego, a za nim Storm, Rogue i Jubilee. Później Jubilee znajduje mutanta wykonanego z czystej stali. Myśląc, że to on jest odpowiedzialny za zdemolowanie szkoły, Jubilee rusza za nim, ale Wolverine stwierdza, że to nie on zniszczył rezydencję, ponieważ inaczej pachniał. Jubilee i Wolverine znajdują Juggernauta napadającego na bank i próbują go schwytać, ale Juggernaut jest zbyt silny. Wkrótce na miejscu zjawiają się pozostali X-Men. Jean wyjaśnia, że nie może mentalnie zaatakować Juggernauta, dopóki jego hełm jest na głowie. Cyclops uważa, że mogą go pokonać, jeśli tylko będą pracować jako zespół.

Lekarz z Centrum Badań nad Mutantami na Wyspie Muir twierdzi, że znalazł lekarstwo na gen mutacji. Rogue udaje się na wyspę w poszukiwaniu tego lekarstwa. Rogue odwiedza doktora Adlera i opowiada mu o tym, jak rozważa leczenie. Dr Adler wysyła ją w drogę i pojawia się Apocalypse. Dr Adler zmienia się w Mystique i rozmawiają o mocach Rogue. Później Cable atakuje doktora Adlera, ale X-Men pokonują go, a Rogue zmienia zdanie na temat leczenia i odchodzi. Pod koniec Warren (Angel) przychodzi na leczenie i wchodzi do laboratorium doktora Adlera. Później Mystique odnajduje Apocalypse'a i mówi mu o Warrenie, na co ten odpowiada, że planuje zniszczyć świat.

Nieśmiertelny mutant Apocalypse zmienia mutantów, którzy udali się na wyspę Muir w poszukiwaniu fikcyjnego lekarstwa, w Jeźdźców Głodu, Zarazy, Wojny i Śmierci. Jeźdźcy zaczynają niszczyć wszystko na całej planecie. Na miejsce przybywają X-Men i walczą z Jeźdźcami. Rogue w końcu chwyta Archangela i pochłania jego pamięć, wysysając z niego moc Apocalypse'a. Archangel, przerażony tym, czym się stał, rozwala pozostałych Jeźdźców. Apocalypse ucieka statkiem kosmicznym, a odwrócenie uwagi pozwala uciec także pozostałym Jeźdźcom.

Mutant o imieniu Bishop podróżuje w czasie z roku 2055 do teraźniejszości, aby powstrzymać członka X-Menów przed zamordowaniem kogoś. Po powrocie do teraźniejszości nie pamięta, kim jest zabójca. Później zwraca się o pomoc do X-Men. Odcinek kończy się cliffhangerem, w którym okazuje się, że podejrzanym jest Gambit.

Bishop strzela do Gambita, X-Men powstrzymują go. Jadą do Waszyngtonu, gdzie Bractwo Mutantów planuje zamach na senatora Roberta Kelly'ego. Mystique podaje się za Gambita i próbuje zabić Kelly'ego, ale prawdziwy Gambit ratuje go. Bishop wraca do swoich czasów. Profesor X odkrywa, że Magneto porwał senatora Kelly'ego, co prowadzi do cliffhangera.

Magneto przyprowadza senatora Kelly'ego na zatopiony statek, aby go zabić, dzięki czemu mutanci i ludzie wypowiedzą sobie wojnę. Sentinele atakują Magneto i porywają senatora Kelly'ego. Kiedy X-Men w końcu znajdują miejsce, gdzie jest Magneto, Sentineli już nie ma wraz z senatorem. Sentinele zabierają senator Kelly do Master Molda. Master Mold chce zastąpić mózgi wszystkich światowych przywódców komputerami, aby Sentinele mogły kontrolować świat. X-Men udają się do bazy Sentineli i ratują senatora. Kelly uświadamia sobie, że niektórzy mutanci mogą być dobrzy. Cyclops i Jean zaręczają się. Pojawia się też wskazówka, że wkrótce poznamy postać o imieniu Sinister.

Trwa ślub Jean Grey i Cyclopsa. Mister Sinister poddaje Morpha praniu mózgu, a następnie wysyła go do Nowego Jorku, gdzie Kevin zaczyna eliminować X-Menów jednego po drugim. Tymczasem Graydon Creed wprowadza w życie swój projekt eksterminacji mutantów.

Udający Magneta Morph zwabia Profesora X na Antarktykę. Mister Sinister porywa Cyclops i Jean. X-Meni wyruszają w pościg za Sinisterem. Tymczasem Profesor X wraz z Magnetem zostają zasypani pod lawiną.

W szeregi X-Menów powraca Storm. Tymczasem coś dziwnego zaczyna się dziać w Afryce. Storm i Rogue wyruszają do Afryki żeby zbadać sprawę. W tym samym czasie pozostali X-Meni szukają Profesora X. Charles i Magneto trafiają do Dzikiej doliny.

Profesor X i Magneto zostają zaatakowani przez dinozaury. Jubilee wraz z Colossusem łapią złodziei, którzy obrabowali sklep. Tymczasem w Rosji trzej skorumpowani generałowie przywracają do życia Omegę Reda.

Jean Grey nadal szuka Profesora X. Tymczasem Vindicator wraz z pozostałymi członkami Alpha Flight chwytają Wolverinea. Chcą żeby wyjawił im sekret swojego szkieletu z adamantium. Vindicator postanawia przeprowadzić eksperymenty na Loganie.

Gambit zostaje zmuszony do powrotu w rodzinne strony na Południe przez pradawną daninę, stary konflikt rodowy i porwanie swojego brata, Bobby'ego. Bella Donna z Gildii Zabójców wykorzystuje uprowadzenie, by zwabić Gambita w swoje sidła i przymusić go do dokończenia przerwanego ślubu. Po wymianie Bobby'ego i daniny za Gambita, Bella przekazuje Złodziejom fałszywą daninę, skazując ich na zagładę z rąk X-Ternala. Na szczęście dla Gambita pozostali X-Meni podążają za nim na mokradła; z pomocą Gambita stawiają czoła Zabójcom w wyznaczonym miejscu i czasie, ujawniając ich podstęp. Kiedy przybywa X-Ternal, Jean Grey nawiązuje z nią telepatyczną więź, zmuszając ją do ujrzenia prawdy. Zdając sobie sprawę z oszustwa, X-Ternal odbiera Belli moce, a X-Meni wracają do domu.

Nowy Jork, rok 3999 n.e. Czas ulega tu samoczynnym zmianom. Cable używa swojego wehikułu czasu i odkrywa, że Bishop przeniósł się z roku 2055 n.e. do teraźniejszości, by powstrzymać zarazę wywołaną przez Apocalypse'a. Ponieważ Bishop nie dopuścił do stworzenia wirusa, nigdy nie powstały przeciwciała chroniące mutantów przed kolejnymi plagami.

Cable przybywa do teraźniejszości, by powstrzymać Bishopa i ocalić swój przyszły świat. Po walce z Bishopem i X-Menami ucieka. Przeglądając dane o X-Menach, zauważa, że może wykorzystać moc samoleczenia Wolverine'a do stworzenia przeciwciał niezbędnych do zachowania jego przyszłości. Z pomocą Wolverine'a Cable ratuje linie czasowe zarówno swoją, jak i Bishopa.

Mr. Sinister wysyła Mystique, by zniszczyła X-Menów pod nieobecność Profesora X, który zaginął w Savage Land. Rogue zaczyna miewać bolesne wizje tajemniczej kobiety, które dosłownie doprowadzają ją do szaleństwa, aż w końcu nieznajoma przejmuje kontrolę nad jej ciałem. X-Meni nie mają pojęcia, że tajemnicza postać skrywa mroczne sekrety z przeszłości Rogue sprzed jej dołączenia do zespołu.

Przyjaciele Ludzkości atakują szpital dla niewidomych, w którym pracuje Beast. Wolverine planuje rozbić ich od środka. Beast zakochuje się z wzajemnością w jednej ze swoich niewidomych pacjentek, Carly. Jej ojciec nienawidzi jednak mutantów i nie zamierza tolerować ich relacji. Kiedy Przyjaciele Ludzkości porywają Carly za zadawanie się z mutantem, drogi Wolverine'a, Beasta i FOH ponownie się przecinają. Tymczasem w Savage Land Xavier i Magneto walczą o przetrwanie.

Mojo, owładnięty manią wielkości międzywymiarowy producent telewizyjny, obsadza X-Menów w swoim najnowszym ogólnogalaktycznym hicie, używając mocy psychicznych, by napuścić ich na siebie na odległej planecie. Spragniony krwi tłum szaleje, a walka X-Menów na śmierć i życie ma zapewnić chciwemu showmanowi rekordowe wyniki oglądalności.

Xavier i Magneto docierają w końcu do samolotu Xaviera, lecz wpadają w zasadzkę mutantów. Ujawnia się nowy władca Savage Land, ale wcześniej zyskują nowego sprzymierzeńca. Morph wysyła X-Menom wiadomość z informacją o swoim położeniu, co prowadzi do starcia z Mr. Sinisterem i jego bandą Nasty Boys.

X-Meni trafiają do Savage Land i podobnie jak Xavier oraz Magneto tracą moce, przez co stają się bezbronni wobec eksperymentów Mr. Sinistera. Jedynymi, którzy mogą ich uratować, są Ka-Zar i Wolverine. Gdy wszyscy odzyskują swoje zdolności, w Savage Land powraca porządek. Jaka jednak przyszłość czeka teraz tę krainę?

Wolverine zostaje zwabiony do tuneli Morlocków przez dawną ukochaną, której towarzyszy grupa cybernetycznych najemników znanych jako Reavers. Wolverine odkrywa, że kobieta, którą kiedyś kochał, zmieniła się nie do poznania – przeszła te same cybernetyczne modyfikacje co Reavers i przybrała nowy pseudonim: Lady Deathstrike. Odkryła pogrzebany przed wiekami obcy statek i potrzebuje adamantiowych pazurów Wolverine'a, by przeciąć jego poszycie.

Uwolniona z obcego statku istota zwana Spirit Drinker zaczyna wysysać siły życiowe z ludzi wokół, w tym z Reavers, Lady Deathstrike i Jubilee. Czy X-Menom uda się odkryć sposób na jej zniszczenie, zanim odebrana energia przepadnie na zawsze?

Wizje Profesora X skłaniają go do wydania polecenia przejęcia promu kosmicznego. Na miejscu drużynę atakuje agent Shi'ar, Erik the Red, który planuje zasadzkę na rebeliantkę Lilandrę po jej wyjściu z tunelu czasoprzestrzennego. Podczas przelotu promu przez pole energii Jean Grey przechodzi niezwykłą transformację.

Sonda psychiczna w postaci wiązki światła sprawia, że Profesor X uwalnia projekcję swojej mrocznej strony, która atakuje X-Menów. Profesor X udaje się na wyspę Muir na rehabilitację, gdzie odwiedza go Lilandra.

Juggernaut i Black Tom Cassidy porywają Lilandrę na zlecenie Erika the Reda, lecz X-Meni wpadają na ich trop. Starcie kończy się patem, dopóki nie zjawia się Gladiator, gwardzista tronu imperialnego, by uwięzić Lilandrę. Phoenix ratuje ją i tymczasowo pokonuje Gladiatora.

X-Menom nie udaje się ochronić Kryształu M'Kraan przed międzygalaktycznymi piratami zwanymi Starjammers, którzy planują sprzedać go D'kenowi i wykorzystać Cyclopsa jako zabójcę. Phoenix teleportuje X-Menów do kryształu, lecz D'ken zdołał już uwolnić jego moc.

X-Meni zostają wciągnięci do walki z D'kenem wewnątrz świata Kryształu M'Kraan, gdzie Phoenix staje do ostatecznego starcia.

Sauron porywa Storm do Savage Land, by żywić się jej energią mutantki. Wolverine, Beast, Rogue i Jubilee ruszają za nim w pogoń do Savage Land.

Garokk łączy się z wulkanem na wyspie oraz z potężną energią planety płynącą pod nim.

Archangela ogarnia obsesja na punkcie zniszczenia Apocalypse'a, którego obwinia o zrujnowanie sobie życia.

Jean zaczyna tracić kontrolę, a Phoenix bezczelnie przejmuje nad nią władzę, kiedy tylko zechce.

Kiedy Mastermind próbuje zmusić Phoenix do zabicia Cyclopsa, ta w końcu wyzwala się spod psychicznej kontroli, zostawiając X-Menów zdanych na własne siły.

Jean Grey, całkowicie zjednoczona z Phoenix, wraca do swojego domu z dzieciństwa, przytłoczona nadmiarem emocji i potężną mocą.

Xavier odczytuje myśli Lilandry i wyzywa jej strażnika na Pojedynek Honorowy o życie Jean Grey, którego Lilandra nie może odrzucić.

Były członek X-Men, Bobby 'Iceman' Drake, zostaje przyłapany na włamaniu do ściśle tajnego obiektu rządowego.

Cyclops i Storm odpowiadają na wezwanie o pomoc od komandora Raknara, po czym odkrywają, że ściganym przez niego człowiekiem jest ojciec Scotta, Christopher Summers, który twierdzi, że został wrobiony.

Życie Juggernauta wisi na włosku, gdy ktoś inny odnajduje Rubin Cyttoraka i przejmuje jego moce dla siebie.

Podczas urlopu Rogue, Gambit i Wolverine muszą chronić Nightcrawlera, mnicha o demonicznym wyglądzie, lecz gołębim sercu, przed zmanipulowaną społecznością.

Wolverine odkrywa, że wszystko w jego dawnym życiu w ramach rządowego programu Broń X było kłamstwem... łącznie z jego romansem ze Silver Fox.

Trevor Fitzroy i Bantam cofają się w czasie do 1959 roku i zabijają Profesora X.

Nie zdoławszy zapobiec zabójstwu Xaviera, Bishop, Shard, Storm i Wolverine przenoszą się do przyszłości.

Morph czuje, że jest wreszcie gotowy na powrót do X-Menów. Jednak jego powitanie przerywa ponowne pojawienie się Sentinelów – robotów polujących na mutantów, które o mało go nie zabiły podczas ich ostatniego starcia.

Długo ukrywany, tajemniczy pacjent z Muir Island, nastoletni mutant potrafiący naginać rzeczywistość, znany jako Proteus, ucieka po 15 latach niewoli i sieje spustoszenie w całej Szkocji w poszukiwaniu swojego ojca.

Gdy Proteus odkrywa, że jego wyrodny ojciec jest wpływowym politykiem, wdziera się do Union Hall w samym środku jego przemówienia wyborczego o „wartościach rodzinnych”. Proteus wyjawia mu, że jest jego synem, lecz ojciec wypiera się go i przerażony ucieka, wzywając pomocy. Wściekły na taką reakcję Proteus wywołuje chaos, jednak Profesor X w końcu go uspokaja, kładąc kres zniszczeniu. Następnie chłopak wraca na Muir Island z Moirą MacTaggert.

Zmęczony walką o dominację mutantów Magneto proponuje przetransportowanie wszystkich mutantów na orbitującą asteroidę zwaną Asteroidą M, gdzie mogliby żyć w spokoju i z dala od ludzi. Fabian Cortez zmusza go jednak do wejścia do kapsuły ratunkowej i wystrzeliwuje go w przestrzeń kosmiczną.

Gdy Magneto bezradnie spada w stronę Ziemi, Fabian Cortez przejmuje kontrolę nad Asteroidą M i wystrzeliwuje w kierunku planety setki pocisków. W tym samym czasie Rogue wyrusza na pomoc X-Menom i próbuje odnaleźć zaginionego Gambita. Magneto uwalnia się i wraca w samą porę, by zniszczyć zarówno pociski, jak i Asteroidę M. Wszyscy uciekają przed zagładą asteroidy i wracają do domu (w tym Gambit!). Z kolei Cortez zostaje uratowany ze spadającej stacji przez Deathbird... oraz Apocalypse'a!

W roku 3999 Apocalypse kradnie komputer Cable'a i cofa się w czasie, by raz na zawsze zakończyć walkę z gorszymi według niego mutantami.

Gdy wyrocznia Oracle, parapsychiczna członkini Gwardii Imperialnej, zostaje porwana przez Apocalypse'a, Profesor Xavier dochodzi do wniosku, że jego plan polega na chwytaniu mutantów o zdolnościach telepatycznych. X-Meni rozdzielają się, by wytropić ich przed złoczyńcami, przez co Wolverine i Shard lądują w samym środku starcia między Archangelem a wojowniczką ninja imieniem Psylocke.

Po zwędzeniu rządowego wehikułu czasu Cable rekrutuje X-Menów do misji mającej na celu zniszczenie źródła nieśmiertelności Apocalypse'a w momencie jego powstawania.

Cable i X-Meni niszczą Komorę Łazarza. Następnie za pomocą komputera Cable'a i Cerebro namierzają nadajnik na ciele Profesora, docierając do osi kontroli. Tam Apocalypse ujawnia swój plan: chce wykorzystać telepatów do zniszczenia całego czasu i stworzenia nowego wszechświata, w którym będzie rządził niepodzielnie. Czując się oszukanym, Magneto atakuje go, do czego dołącza przybyły właśnie Cable. Apocalypse zaczyna wysysać energię z telepatów, sprawiając, że czas i historia zaczynają znikać. Widząc to, Bishop uwalnia uwięzionych. Sinister i Nasty Boys uciekają. Bohaterowie pokonują Apocalypse'a i jego Jeźdźców. Korzystając ze statku czasoprzestrzennego Cable'a, wszyscy wracają do teraźniejszości do posiadłości X-Menów, po czym Cable odlatuje do swoich czasów.

Pierwsze Święta Jubilee z X-Menami nie przebiegają tak, jak się spodziewała, gdy wraz ze Storm i Wolverine'em wplątuje się w misję ratowania małego Morlocka o imieniu Leech.

Tracący nad sobą kontrolę Wolverine opuszcza X-Menów i wraca na japońską prowincję z czasów młodości, by odnaleźć samego siebie. W spokoju współpracuje ze swoim dawnym duchowym mistrzem, mnichem Oku, przy budowie świątyni. Jednak sąsiedniej wiosce grozi najazd bandytów pod wodzą bezlitosnego Silver Samuraia, chyba że mieszkańcy zapłacą okup. Część z nich chce się sprzeciwić i prosi Wolverine'a o pomoc. Ten bije się z myślami – to dokładnie to, co chciał zostawić za sobą. Wolverine pokonuje Samuraia w pojedynku, wykorzystując jego zwyczaj teleportowania się za plecy wroga: przewiduje ten ruch, niszczy urządzenie do teleportacji i kompromituje Samuraia.

Szkolna miłość Rogue, chłopak, którego zapadł w śpiączkę po pierwszym przebudzeniu jej mocy, nieoczekiwanie wraca do jej życia. Jaki jednak ma to dziwny związek z owadopodobnymi obcymi, na których Wolverine natrafił na pustyni?

Gdy Cyclops leci samotnie do małego pustynnego miasteczka na zachodzie, by odwiedzić starego przyjaciela, jego samolot zostaje zestrzelony. Ranny i pozbawiony możliwości używania swoich mocy dociera do osady, gdzie odkrywa, że jego przyjaciel zaginął, a całą okolicę terroryzuje bojówkarska, antyludzka sekta mutantów – Dzieci Cienia.

Kiedy Profesor X doznaje lekkiego wstrząsu mózgu, jego potężny umysł telepaty nagle staje się podatny na manipulację. Wykorzystuje to Shadow King, który przejmuje kontrolę nad ciałem Xaviera, więżąc jego świadomość w planie astralnym.

Scarlet Witch, Quicksilver i Magneto zostają zwabieni w pułapkę i schwytani przez High Evolutionary'ego oraz jego Nowych Ludzi. Trafiają do celi razem z Wolverine'em, który wcześniej śledził Magneto. Evolutionary wyjawia, że chce wykorzystać ich geny i moce do stworzenia nowej rasy istot, co demonstruje, zmieniając Wolverine'a w wilkołaka. Ujawnia również, że Magneto jest ojcem Quicksilvera i Scarlet Witch. Magneto przyznaje się bliźniętom, że żałuje opuszczenia ich matki, a swojej żony, Magdy. Beast i Profesor X namierzają ich kryjówkę, podczas gdy Magneto uwalnia pozostałych, a High Evolutionary ucieka. Wolverine wraca do ludzkiej formy, a bliźniaki odchodzą od Magneto, odrzucając jego próby pojednania.

X-Meni zostają zaatakowani przez Phalanx, rasę technoorganicznych obcych dążących do zasymilowania wszelkiego życia na Ziemi. Kosmita Warlock sprzymierza się z Beastem, Forge'em i Mister Sinisterem, aby powstrzymać najeźdźców.

Planeta Ziemia jest atakowana przez Phalanx, rasę technoorganicznych obcych dążących do asymilacji wszelkiego życia. Warlock, Beast, Forge, Mister Sinister i Amelia Voght opracowują antywirus oraz plan wprowadzenia go prosto do rdzenia Phalanxu. Rekrutują do pomocy Magneto, któremu udaje się zdobyć próbkę wroga. Hodge tłumaczy im cele Phalanxu i to, w jaki sposób sam stał się jego częścią. Grupa wkracza do Iglicy Phalanxu, próbując ocalić resztę i unicestwić rasę za pomocą antywirusa.

Omega Red, maszyna do zabijania z byłego Związku Radzieckiego i zaprzysięgły wróg Wolverine'a, zostaje odmrożony i wysłany ponad trzy kilometry w głąb oceanu, by zabezpieczyć uszkodzony okręt podwodny z napędem jądrowym i toksycznym ładunkiem, grożący katastrofą u wybrzeży Hawajów. Stawia jeden warunek: Wolverine i Storm muszą zejść pod wodę razem z nim jako gwarancja bezpieczeństwa.

Cyclops, wciąż pogrążony w żałobie po śmierci Phoenix, odchodzi z X-Menów i wraca do sierocińca, w którym się wychował, gdzie spotyka dawną znajomą, Sarah. Zaczyna podejrzewać, że jej bogaty dobroczyńca, Zebediah Killgrave, knuje coś złego, gdy ten z niewiadomych przyczyn zaczyna adoptować dzieci mutantów.

Longshot, buntownik z innego świata, trafia na Ziemię całkowicie pozbawiony pamięci. Znajduje go Jubilee, która od razu czuje do niego sympatię. Wkrótce oboje muszą uciekać przed Mojo i jego łowcami.

Graydon Creed próbuje wkupić się z powrotem w łaski Przyjaciół Ludzkości, porywając i wydając swoją matkę oraz przyrodniego brata, którzy oboje są mutantami. Nightcrawler otrzymuje tajemniczą wiadomość, że jego biologiczna matka, której nigdy nie poznał, jest w tarapatach. Zwraca się o pomoc do Wolverine'a, Rogue i Jubilee. Razem infiltrują bazę Przyjaciół Ludzkości w jej poszukiwaniu. Sytuacja komplikuje się jeszcze bardziej, gdy jeden z członków drużyny rozpoznaje głos kobiety.

Kosmita Arkon przybywa na Ziemię i błaga Storm, aby wróciła z nim na jego planetę i ocaliła ją przed meteorologicznym chaosem, który zagraża jego ludowi.

Trwają szybkie i widowiskowe przygotowania do ślubu Storm z Arkonem.

Jubilee oprowadza grupę dzieci po jaskini na terenie posiadłości, gdzie zostają uwięzieni przez zawał. Gdy poziom wody w jaskini się podnosi, dziewczyna uspokaja maluchy, snując średniowieczną bajkę o rycerzach, księżniczkach, trollach i smokach. Niektóre z tych postaci mogą do złudzenia przypominać członków X-Men. W trakcie jej opowieści prawdziwi X-Men przybywają z ratunkiem.

Fabian Cortez porywa Jubilee, ponieważ Apocalypse został uwięziony na Płaszczyźnie Astralnej i pilnie potrzebuje ciała nosiciela.

Odwiedzając grób przyjaciela na cmentarzu wojskowym we Francji, Wolverine wspomina dawną wspólną misję, podczas której walczył z nazistami i Red Skullem, mając u boku samego Captaina Americę.

Rodzice Sama Guthrie kontaktują się z Profesorem Xavierem w sprawie zmutowanych zdolności syna.

Poznajemy genezę Mr. Sinistera, podczas gdy dr Xavier próbuje powstrzymać Essexa, zanim ten posunie się za daleko.

W obliczu ostatecznego starcia Magneto z ludźmi, X-Men proszą go o ocalenie umierającego Profesora X. Jakiego wyboru dokona?