Gwiezdne wojny: Wojny klonów

W Galaktyce podzielonej przez wojnę, światy pragnące pokoju muszą poprzeć którąś ze stron, by oddalić groźbę inwazji. Separatyści i siły Republiki starają się pozyskać dla swojej sprawy neutralne planety. Mistrz Yoda spieszy z tajną misją na jeden z neutralnych księżyców w systemie Toydaria. Stawką jest budowa bazy zaopatrzenia dla sił Republiki.

Gwiezdna flota klonów otoczona. Dziesiątki krążowników Republiki uległy zniszczeniu w zasadzkach, w których nikt nie uszedł z życiem. Krążą wieści o nowej, strasznej broni Separatystów. W obliczu rosnącego zagrożenia Rada Jedi wysyła Mistrza Plo Koona, by wytropił zagrożenie zanim przyjdzie przyjąć kolejny atak.

Śmiercionośna broń nadciąga. Niepowstrzymany krążownik Separatystów - Malevolance przemierza przestrzenie Republiki niszcząc każdy statek na swej drodze. Po śmiałej akcji ratunkowej i szczęśliwej ucieczce Anakin Skywalker przygotowuje kontratak na statek wroga i jego diabolicznego przywódcy droidów - Generała Grievousa.

Grievous ucieka! Zanim krążownik Malevolence zdążył zniszczyć bazę medyczną klonów na Zewnętrznych Rubieżach, grupa uderzeniowa pod dowództwem Generała Jedi - Anakina Skywalkera zdołała uszkodzić statek, unieszkodliwiając jego potężne działo jonowe. Teraz Jedi prowadzą nieprzerwany pościg za Malevolence.

Mobilizacja wojsk klonów. Na Zewnętrznych Rubieżach Galaktyki, chronionych przez nielicznych Jedi narastają konflikty. Z powodu stałego zapotrzebowania na żołnierzy generałowie Jedi podjęli decyzję o przyspieszeniu klonowania. Wiele młodych klonów wyrusza do boju nieukończywszy nawet szkolenia. To oni, obsługując sieć stacji zwiadowczych, stanowią bardzo słabą zaporę pomiędzy Republiką a jej wrogami.

Po serii dotkliwych porażek z siłami Generała Grievousa bazy wypadowe Republiki są zagrożone. Tylko Anakin Skywalker i jego oddział z rozkazem obrony ważnego punktu strategicznego Bothawui stoją na drodze armii droidów.

Zaginiony w akcji! R2-D2 - droid nawigacyjny Anakina Skywalkera zaginął w czasie bitwy. Gdy gorączkowe poszukiwania nie przynoszą rezultatu, Anakin zmuszony jest przyjąć nowego nawigatora - R3-S6. Teraz Jedi szykują się do nowej misji znalezienia tajnego posterunku nasłuchowego wroga. Tymczasem R2-D2 wpadł w ręce nikczemnego przemytnika droidów i jest w drodze do Generała Grievousa, który podstępnie chce go wybawić z tajników Republiki.

Wojna Klonów zagraża jedności Republiki. Przez galaktykę przetacza się bitwa za bitwą, a coraz więcej światów daje się uwieść Separatystom i opuszcza Republikę. Senator Padme Amidala wyrusza z misją pokojową do położonego na Zewnętrznych Rubieżach świata Rodii, chcąc upewnić się że pozostanie on wierny Republice.

Wicekról Gunray pojmany. Senator Padme Amidala odnosi zwycięstwo nad Sojuszem Separatystów w odległym systemie Rodia. Biorąc do niewoli diabolicznego przywódcę konfederatów Nute'a Gunraya. Rada Jedi wyznaczyła mistrzynię Luminarę Unduli i padawana Anakina Skywalkera - Ahsokę do specjalnej eskorty wicekróla na Coruscant. Tam, podczas procesu, odpowie za swoje zbrodnie wojenne.

Wicekról Gunray ucieka. W drodze na Coruscant, gdzie miał odpowiedzieć za swoje zbrodnie, przywódca Separatystów - Nute Gunray, wymyka się eskorcie Jedi. Z pomocą popleczników Hrabiego Dooku nikczemnemu wicekrólowi udaje się zbiec. Uprzedzony o śmiałej ucieczce mistrz Jedi - Kit Fisto namierzył skradziony statek w odległym systemie, licząc na pojmanie Gunraya i postawienie go przed sądem.

Podczas własnej próby porwania hrabiego Dooku, Anakin i Obi-Wan odkrywają, że Lord Sithów został już schwytany przez piratów. Hondo Ohnaka i jego banda piratów trzymają Dooku w niewoli w swojej jaskini na Florrum i przetrzymują go dla okupu. Od Anakina i Obi-Wana zależy, czy oferta jest zbyt piękna, aby była prawdziwa.

Anakin i Obi-Wan zostali oszukani i są przetrzymywani dla okupu wraz z hrabią Dooku przez wodza piratów Hondo Ohnakę i jego zastępcę, Turka Falso. Podczas gdy Anakin, Obi-Wan i Dooku bezskutecznie próbują uciec, Republika wysyła okup przez specjalnego wysłannika, w tym przedstawiciela Jar Jar Binksa. Kiedy Falso próbuje ukraść okup od swojego szefa, zestrzeliwując wahadłowiec, jedynymi ocalałymi jest oddział klonów i Jar Jar, który jako najwyższy z żyjących oficerów musi przejąć misję. Staje się wyścigiem z czasem, gdy Jar Jar pędzi, by dostarczyć okup, by przejąć opiekę nad Dooku i uratować Jedi.

Anakin i Ahsoka przybywają do podniebnej bitwy, aby pomóc oblężonej generał Jedi Aayli Secura. Anakin zostaje ciężko ranny w walce. Aayla i Ahsoka wraz z rannym Anakinem, Rexem i ocalałymi klonami lądują na niezbadanej, porośniętej trawą planecie Maridun. Zmuszona do opuszczenia Anakina, aby go uratować, Aayla uczy Ahsokę, dlaczego Jedi nie mają osobistych przywiązań. Udają się do wioski Lurmen. Ich władca, Tee Watt Kaa, wyjaśnia, że ​​są pacyfistami w tej wojnie i nie są sprzymierzeni z żadną ze stron. Niepewny, czy mieć coś wspólnego z Jedi, Tee Watt Kaa zgadza się pomóc uratować życie Anakina.

Przywódca Lurmenów, Tee Watt Kaa, odmawia schronienia Jedi przed przybyciem sił Separatystów, obawiając się, że taka akcja niepotrzebnie wciągnie jego neutralnych ludzi do wojny. Ahsoka, Aayla, ranny Anakin i reszta klonów szanują ich życzenia, ponieważ nie chcą narażać wioski swoją obecnością, więc muszą wycofać się w dzikie tereny planety. Separatystyczny generał Neimoidian Lok Durd przybywa, aby przetestować niszczycielską broń, której planują użyć na Lurmenach! Ostatecznie mieszkańcy wioski muszą zdecydować, czy poddadzą się Separatystom, czy będą walczyć z Jedi w obronie swojej wioski.

Przybywając na opustoszały lodowy świat Orto Plutonia, Anakin Skywalker i Obi-Wan Kenobi badają zniknięcie sklonowanych sił bezpieczeństwa stacjonujących na odległym posterunku. Jedi, w towarzystwie senatora Riyo Chuchi i przewodniczącego Cho z pobliskiego księżyca Pantora, wkrótce odkrywają, że ich żołnierze-klony zostali zaatakowani przez plemię futrzastych tubylców znane jako Talz. Zaciekli wojownicy jeżdżący na bestiach, Talz są bardzo terytorialni i chcą tylko zostać sami. Jedi udaje się wynegocjować pokój z wodzem Talz, Thi-Senem, gdy chciwy Przewodniczący Cho łamie go, twierdząc, że planeta i Talz są pod jego władzą. Wynikający z tego konflikt przeradza się w wojnę między klonami pod dowództwem senatora a Talzem, z Jedi pośrodku.

Anakin Skywalker i Obi-Wan Kenobi dowodzą siłami Republiki, próbując pokonać armie droidów i uwolnić planetę Christophsis z oblężenia Separatystów. Kiedy Republika wpada w zasadzkę i zostaje zmuszona do odwrotu, staje się jasne, że ktoś pośród nich zaatakował ich. Jedi wierzą, że ta infiltracja jest operacją wspieraną przez Sithów i udają się za linie wroga, aby zbadać sprawę. Tymczasem kapitan Rex i komandor Cody wyruszają, by odkryć wśród nich zdrajcę.

Republika odkrywa laboratorium broni biologicznej Separatystów ukryte na planecie Naboo. Zamiast czekać na pomoc, Padmé; bada laboratorium z Jar Jarem. Anakin, Ahsoka, Rex i Obi-Wan przybywają i podążają za nią. Odkrywają, że senator jest przetrzymywany w niewoli przez złowrogiego dr Nuvo Vindi. Szalony naukowiec pracuje nad śmiercionośnym wirusem dla Separatystów. Vindi grozi, że zdetonuje bombę i uwolni wirusa!

Mimo że laboratorium zostało zamknięte, dr Vindi udaje się aktywować przerażającego wirusa Blue Shadow, zarażając Ahsokę, Padmé i wielu żołnierzy-klonów. Plaga jest śmiertelna w ciągu 48 godzin. Anakin i Obi-Wan muszą udać się na tajemniczą planetę Iego, aby zdobyć jedyne znane antidotum na chorobę. Anakin i Obi-Wan przybywają na tajemniczą planetę, aby odkryć, że jej populacja żyje w strachu przed tajemniczą siłą, która zabija wszystko, co próbuje opuścić ich świat. Z pomocą Jaybo Hooda, sprytnego chłopca z Iegoana, Anakin i Obi-Wan muszą rozwiązać tajemnicę planety, zanim będą mogli odejść i zanim zginą wszyscy zarażeni wirusem Separatystów!

Ryloth, ojczysty świat ludu Twi'lek, został poddany okupacji wojskowej przez armię droidów Separatystów i otoczony blokadą pancerników Federacji Handlowej. Podczas niespodziewanego ataku na blokadę Ahsoka sprzeciwia się rozkazom Anakina i traci większość swojej eskadry. Mimo tego, że ta porażka wstrząsa nią emocjonalnie, Anakin pomaga jej nauczyć się wytrwać, stawiając ją na czele kolejnego ryzykownego ataku.

Po zniszczeniu blokady kosmicznej wokół Ryloth, Obi-Wan Kenobi musi poprowadzić małą grupę klonów do miasta okupowanego przez droidów, aby sabotować ich działa przeciwlotnicze. Misja Obi-Wana komplikuje się, gdy dowiaduje się, że mieszkańcy miasta są wykorzystywani jako żywe tarcze. Para klonów w jego plutonie nawiązuje niezwykłą przyjaźń z uchodźczynią z Twi'leków, Numą, osieroconą przez wojnę. Dzięki ich relacjom z nią klony zaczynają rozumieć prawdziwe koszty wojny...

Bitwa o Ryloth, ojczyznę Twi'leków, szaleje, gdy Republika próbuje odeprzeć okupującą armię droidów dowodzoną przez przywódcę separatystów, Wat Tambor. Mając rozciągnięte siły, Mace Windu musi przekonać bojownika o wolność Twi'leków, Chama Syndullę, by pomógł mu ocalić stolicę przed zniszczeniem przez droidy. Początkowo bohater Twi'leków waha się, czy pomóc Mace'owi, ale ostatecznie zdaje sobie sprawę, że Jedi można zaufać i dołącza do niego, aby wyzwolić miasto - a ostatecznie planetę - w kulminacyjnej bitwie.

Chcąc wymusić uwolnienie zbrodniarza Ziro Hutta z więzienia, łowcy nagród przejmują kontrolę nad budynkiem Senatu i przetrzymują członków Senatu jako zakładników. Cad Bane, przywódca operacji, z pomocą łowczyni nagród Aurry Sing, kieruje swoje żądania do kanclerza Palpatine'a, który nie ma innego wyjścia, jak tylko spełnić jego prośbę. Bez wiedzy myśliwych Rycerz Jedi Anakin Skywalker przebywa na wolności w budynku Senatu.

Cad Bane został wynajęty przez Dartha Sidiousa do kradzieży holokronu Jedi. Holokrony – systemy przechowywania danych, które można otworzyć tylko za pomocą Mocy – są chronione w skarbcu w Świątyni Jedi. Werbując do swojego spisku uzurpatora udającego Jedi, Bane infiltruje systemy bezpieczeństwa budynku i prowadzi pościg Anakina, Obi-Wana i Ahsoki.

Anakin i Ahsoka podróżują na planetę Devaron w pogoni za Cadem Bane'em, który ukradł holocron Jedi. Bane schwytał mistrza Jedi Bollę Ropala, strażnika kryształu Kyber, który w połączeniu z holocronem ujawni dane na temat każdego znanego dziecka wrażliwego na Moc w galaktyce. Bane nie może zmusić Ropala do otwarcia holokronu, więc Bane potrzebuje kolejnego Jedi. Łapiąc Ahsokę, łowca nagród zmusza Anakina do otwarcia holokronu, aby uratować swojego padawan. Ujawnione sekrety holocronu Bane próbuje uciec, ale wydaje się, że został zabity przez klona. Anakin jednak wciąż wyczuwa obecność Bane'a w Mocy...

Cad Bane ukradł holocron Jedi, w którym znajdują się sekretne miejsca wrażliwych na Moc dzieci galaktyki. Bane otrzymuje od Dartha Sidiousa zadanie porwania kilku dzieci, aby wyszkolić ich na szpiegów Sithów. Podczas jednej z takich prób porwania Bane zostaje schwytany przez Anakina i Ahsokę i zabrany przed Obi-Wana i Mace'a Windu, aby zbadali jego umysł. Nie mogąc oprzeć się połączonym mocom Mocy Jedi, Bane zgadza się poprowadzić Kenobiego i Windu do swojej ukrytej bazy, podczas gdy Anakin i Ahsoka wyruszają do Mustafar, aby uratować skradzione dzieci przed złym spiskiem Dartha Sidiousa.

Rada Jedi podejrzewa, że ​​senator Rush Clovis, delegat Międzygalaktycznego Klanu Bankowego i były kolega Padmé Amidali, może pracować dla Separatystów. Wbrew życzeniom Anakina, Rada prosi Padmé, czy towarzyszyłaby Rushowi do Cato Neimoidia, aby odkryć wszelkie wskazówki dotyczące prawdziwych przynależności senatora. Padmé zgadza się, czując, że jej przeszły związek z senatorem – który przez pewien czas był romantyczny, dopóki go nie zakończyła – może dać jej przewagę w śledztwie. Odpierając zazdrość Anakina, a także zamach na jej życie przez Neimoidiana Lotta Doda, Padmé z powodzeniem ujawnia, że ​​Clovis spiskuje z Separatystami, aby zbudować fabrykę droidów wojskowych na Geonosis.

Anakin, Obi-wan i Ki-Adi-Mundi prowadzą inwazję, aby powstrzymać Poggle'a Mniejszego i Geonosjan przed odbudową ich armii droidów. Sprawy przybierają okropny obrót, gdy siły Geonosian zestrzeliwują statki Republiki, które spadają z kursu. Pod rosnącą presją, by wykonać swoją misję, Anakin, Obi-Wan i Ki-Adi-Mundi mają do pokonania własny zestaw wyzwań – hordy wrogich żołnierzy, śmiercionośne pułapki, bezlitosny teren i potężna tarcza energetyczna.

Anakin, Ahsoka, Luminara Unduli i jej padawan, Barriss Offee, prowadzą misję zniszczenia fabryki droidów na Geonosis. Ale Poggle the Lesser ma inne plany, gdy wykorzystuje swoją najnowszą broń, niezniszczalne super czołgi. Zdesperowani, aby wykonać swoją misję, zanim odlewnia zostanie uruchomiona, Jedi opracowują śmiały plan, w którym Anakin i Luminara będą działać jako wabiki, odwracając uwagę superczołgów, podczas gdy Ahsoka i Barriss infiltrują fabrykę przez labirynt katakumb pod miastem. Plan jest ryzykowny. Stawka jest wysoka. To ich jedyna opcja, ale czy padawani sprostają wyzwaniu?

Po bitwie mającej na celu zniszczenie nowej fabryki droidów na Geonosis, mistrzyni Jedi Luminara Unduli znika, tropiąc Poggle'a Mniejszego. Obi-Wan i Anakin prowadzą pluton żołnierzy-klonów w poszukiwaniu jej. Idąc jej śladem, nasi bohaterowie schodzą w głąb legowiska Kariny Wielkiej. Ku swojemu przerażeniu dowiadują się, że ul jest żywy i pełen nieumarłych obrońców. Podobno Karina potrafi reanimować i kontrolować swoich poddanych. Czy Obi-Wan i Anakin pokonają hordę nieumarłych Kariny i znajdą Luminarę, zanim będzie za późno?

Zaopatrzenie medyczne jest rozpaczliwie potrzebne na kluczowym froncie bitwy Republiki. Podczas gdy Rycerze Jedi przewożą Poggle'a Mniejszego jako więźnia na Coruscant, padawani Barriss Offee i Ahsoka Tano zostają wysłani, by eskortować fregatę medyczną do miejsca przeznaczenia. Gdy geonozyjskie robaki mózgowe przejmują kontrolę nad żołnierzami-klonami na pokładzie ich statku zaopatrzeniowego, Ahsoka i Barriss muszą walczyć, aby powstrzymać statek przed rozpętaniem śmiertelnej plagi na galaktykę.

Mistrz Jedi Eeth Koth zostaje wzięty jako zakładnik i torturowany przez generała Grievousa. Anakin Skywalker, Obi-Wan Kenobi i Adi Gallia obmyślają śmiały plan ratunkowy, ale wkrótce zdają sobie sprawę, że generał ma własny plan. Rycerze Jedi i generał Separatystów próbują wymanewrować się nawzajem w walce między statkami i wręcz nad planetą Saleucami.

Generał Grievous zostaje zestrzelony nad Saleucami i ląduje na pustyni. Obi-Wan prowadzi ekspedycję, którą opisuje ogólnie droidów. Rex zostaje ranny podczas poszukiwań i musi pieszo do siebie w stodole lokalnego farmera, ale jest zszokowany, gdy przebuduje, że rolnik jest dezerterem-klonem.

Podczas zadania w podziemiach Coruscant przebiegły kieszonkowiec kradnie miecz świetlny Ahsoki. Ahsoka korzysta z pomocy starożytnej Jedi, Tery Sinube, aby wytropić jej broń i odzyskać jej honor.

Alarmujące plotki o pokojowo nastawionej księżnej Satine z Mandalore skłaniają Obi-Wana do zbadania odludnej planety. Satine chce zachować neutralność Mandalore w Wojnach Klonów, ale działania brutalnej grupy odłamowej — Straży Śmierci — grożą popchnięciem planety w kierunku wojny.

Księżna Satine podróżuje z Mandalore na Coruscant z misją dyplomatyczną z Obi-Wanem Kenobim, Anakinem Skywalkerem i zespołem żołnierzy, którzy mają ją bronić. Gdy jej luksusowy statek kosmiczny, Coronet, przedziera się przez nadprzestrzeń, Jedi muszą powstrzymać kilka prób zamachu, a Anakin odkrywa, że ​​Obi-Wan i księżna mają wspólną historię.

Na Coruscant do księżnej Satine dociera wiadomość, że Straż Śmierci mobilizuje, wywołując prewencyjną inwazję Republiki. Uciekając przed władzami Republiki, Satine i Obi-Wan wyruszają, by odkryć prawdziwe motywy grupy.

Kiedy senator Onaconda Farr umiera w podejrzanych okolicznościach, a lokalny inspektor wydaje się niekompetentny, Padmé; postanawia odnaleźć osobę, która otruła swojego mentora. Podążając tropem wskazówek, Padmé i Bail Organa zagłębiają się w niebezpieczny świat dźgnięć w plecy, kłamstw i sekretów kontrolowanych przez potężnych senatorów Mee Deechi i Halle Burtoni. Poszukiwania Padmé zmuszają ją do zaryzykowania kariery i ideałów, ale prawdziwa tożsamość zabójcy jest jeszcze bardziej destrukcyjna, niż mogła sobie wyobrazić.

Blokada separatystów otacza Christophsis. Flota Anakina ma za zadanie rozmieścić na powierzchni zapasy pomocy humanitarnej, ale są one masowo niszczone i wymanewrowane przez zręczny Admirał Trench. Obi-Wan przybywa i przedstawia nową broń Republiki: statek do ukrywania się. Niewidzialny statek jest ostatnią nadzieją na pokonanie przebiegłego dowódcy floty Separatystów i pomoc poturbowanym mieszkańcom Christophsis.

Anakin, Obi-Wan i Ahsoka wpadają na Felucię i szukają pomocy u lokalnych hodowców przypraw tylko po to, by dowiedzieć się, że to rolnicy są w prawdziwej potrzebie. Napastowani przez Hondo Ohnakę i jego bandę piratów, którzy planują ukraść ich plony, rolnicy wynajęli czterech zabójczych łowców nagród, aby chronić ich towary. W mało prawdopodobnym partnerstwie Jedi muszą współpracować z wynajętymi broniami farmerów, aby odeprzeć Hondo i jego bandytów.

Zdesperowany, by odwrócić losy zaciętej bitwy na Malastare i wygrać strategiczny sojusz z Dugami, kanclerz Palpatine rozkazuje Jedi zrzucić najnowszą superbroń Republiki, nieprzetestowaną elektro-bombę protonową. Niestety, wybuch bomby budzi starożytną i przerażającą Bestię Zillo, potwora o legendarnych rozmiarach i zaciekłości. Teraz Jedi muszą powstrzymać tę śmiertelną istotę pomimo ingerencji krwiożerczych Dugów, którzy mają swój własny plan.

Na rozkaz Palpatine'a siły Republiki przenoszą przerażającą Bestię Zillo z powrotem na Coruscant w celu przeprowadzenia badań naukowych. Palpatine, chcąc wydobyć tajemnice bestii dla korzyści militarnych, nakazuje swojemu głównemu naukowcowi zbadanie, a następnie zabicie potwora. Przepełniona bólem i złością Bestia Zillo ucieka z laboratorium i zaczyna niszczyć miasto. Wkrótce Anakin, Padmé i Palpatine zostają ścigani przez bestię, podczas gdy Jedi walczą o jej powstrzymanie.

Zdeterminowany, by zabić mistrza Jedi Mace Windu, młody Boba Fett udaje kadeta-klona i zakrada się na pokład krążownika Jedi, aby podłożyć bombę w kwaterze Windu. Ale plan Boby idzie nie tak, gdy wybuch nie zabija Mace'a i nagle każdy klon na pokładzie szuka sabotażysty. Boba niszczy reaktor statku, aby odwrócić uwagę i wkrótce cały krążownik zaczyna się rozpadać. Nieświadomi, że Boba jest winowajcą, nowi towarzysze kadetów Boby ratują mu życie, ale czy ma obsesję na punkcie zemsty, by zrobić dla nich to samo?

Boba Fett i jego grupa łowców nagród prowadzą Anakina i Mace'a w śmiertelną pułapkę na Vanqor. R2-D2 musi wrócić na Coruscant i ostrzec Jedi przed niebezpieczeństwem ich braci. Walcząc po drodze z bestiami i łowcą nagród, zaufany droid w końcu przekazuje swoje ostrzeżenie Ahsoce i Plo Koonowi, którzy pędzą do Vanqor, by uratować Mace'a i Anakina przed ognistą śmiercią.

Po nikczemnej próbie zamordowania Anakina Skywalkera i Mace'a Windu na Vanqor, Boba Fett i Aurra Sing ukrywają się. Mistrz Jedi Plo Koon i Ahsoka Tano wyruszają, by schwytać łowców nagród. Przeczesując niższe czeluście podziemi Coruscant, Plo i Ahsoka w końcu dowiadują się, że Fett i jego grupa ukrywają się na Florrum. W dramatycznej rozgrywce Fett zostaje porzucony przez Aurrę Sing, pozostawiając młodego Boba zły i zgorzkniały w areszcie Republiki.

Pięć upartych klonów walczy o ukończenie treningu na Kamino. Ci kadeci - Hevy, Cutup, Droidbait, Fives i Echo - wydają się być „złą grupą” i nie mogą pracować jako zespół. Podczas gdy Shaak Ti i instruktorzy musztry Bric i El-Les dyskutują o losie kadetów, klony uczą się współpracować i akceptować swoje przeznaczenie jako żołnierzy.

Republika dowiaduje się o zbliżającym się ataku Separatystów na Kamino, a Anakin i Obi-Wan pędzą na planetę. Po odparciu dywersyjnego ataku Separatystów przez Republikę, rozpoczyna się prawdziwy atak. Asajj Ventress, generał Grievous i armia droidów wynurzają się z oceanów, chcąc zniszczyć obiekty produkcyjne klonów Kamino. Rex, Cody, Piątki i Echo prowadzą klony w desperackiej obronie swojej macierzystej planety.

Ryloth jest oblężony. Uwięziony na powierzchni mistrz Jedi Di gromadzi lokalne siły z pomocą Cham Syndulla. Zdesperowana, by ich uratować, Rada Jedi wysyła senatora Baila Organę i przedstawiciela Jar Jar Binksa na planetę Toydaria, gdzie mają przekonać neutralnego regenta, króla Katuunkę, do wysłania pomocy Ryloth. Bail and Jar Jar muszą przekonać Toydarię, że ich sprawa jest słuszna - zanim będzie za późno. Lott Dod, wysłannik Federacji Handlowej, próbuje powstrzymać Toydarian przed rezygnacją z ich neutralności. Katuunko podąża za swoim sumieniem i potajemnie pomaga Republice, którą Jar Jar jest w stanie ukryć przed szpiegującymi agentami Federacji Handlowej swoimi niepowtarzalnymi rozrywkami.

Chi Eekway i Che Amanwe, córki prezesa Papanoidy, zostają porwane i przetrzymywane w celu zapłacenia okupu. Ahsoka Tano łączy siły z senatorem Pantory, Riyo Chuchi, aby pomóc nowemu przewodniczącemu w odzyskaniu jego rodziny, zanim Federacja Handlowa będzie mogła nadmiernie wpłynąć na przyszłość jego planety. Przewodniczący i jego syn, Ion, tropią porywacza - Greedo - na Tatooine i ratują Che Amanwe. W międzyczasie Ahsoka i Chuchi znajdują Chi Eekwaya przetrzymywanego na pokładzie blokującego pancernika Federacji Handlowej nad Pantorą i ujawniają oficera Federacji Handlowej Siba Canaya jako spiskowca Separatystów.

Padmé, z misją dyplomatyczną w Mandalore, gwarantuje pacyfistycznej planecie Republikę, ale ona i księżna Satine wkrótce odkrywają, że pod pogodną fasadą planety czai się coś złowrogiego. Przemytnicy z Moogan wykradali zapasy, w tym butelkowaną herbatę przeznaczoną dla szkół Mandalorian. Aby zwiększyć swoje zyski, rozcieńczali herbatę niebezpieczną substancją chemiczną.

Ahsoka zostaje przydzielona do prowadzenia zajęć w akademii przywódczej w Mandalore. Wkrótce po jej przybyciu gorliwy siostrzeniec księżnej Satine - Korkie - i jego koledzy z klasy odkrywają nikczemny spisek. Premier Almec okazuje się być aktywnym uczestnikiem spisku czarnorynkowego na Mandalore i próbuje trwale uciszyć księżną Satine i kadetów, zanim ujawnią jego korupcję. Ahsoka i kadeci pokonują Almeca, zanim mu się uda.

Zadaniem Padawana Ahsoki Tano, który ma chronić senator Padmé Amidala podczas misji politycznej na Alderaan, są powracające wizje niedawno zmarłej łowcy nagród, Aurry Sing. Niezdolna do oczyszczenia umysłu, Ahsoka martwi się, że stres związany z konfliktem w końcu dotrze do niej, dopóki jej wizje nie okażą się prorocze. Padmé ledwo unika śmierci, gdy Aurra Sing próbuje ją zabić. Padmé i Ahsoka wspólnie łapią łowcę, a Ahsoka odkrywa prawdziwego złoczyńcę, który stoi za spiskiem mającym na celu zabicie Padmé: uwięzionego gangstera Ziro the Hutt.

W środku rutynowej wyprawy na zakupy na Coruscant, C-3PO zostaje porwany przez łowcę nagród Cad Bane'a. Bane szuka informacji o budynku Senatu w imieniu Jabby the Hutt. Znajdując C-3PO pozbawione przydatnych informacji, Bane i jego wspólnicy porywają R2-D2 i wydobywają istotne dane, zanim wyczyszczą pamięć robotów incydentu i pozwolą im wyruszyć w drogę. Plany pięter i szczegóły bezpieczeństwa budynku Senatu są częścią spisku zaprojektowanego przez rodziny Hutt w celu uwolnienia ich uwięzionego brata, Ziro the Hutt, który posiada potencjalnie szkodliwe informacje o działalności Huttów.

Cad Bane wyciągnął Ziro the Hutt z więzienia. Rada Huttów żąda, aby Ziro powiedział im, gdzie ukrył ważne - i obciążające - informacje: dziennik opisujący przestępczą działalność rodzin Hutt. Ziro dokonuje kolejnej brawurowej ucieczki z pomocą swojego obcego (i dziwnego) kochanka, Sy Snootlesa. Bane wraca na trop Hutta - ale nie jest jedyny. Jedi Obi-Wan Kenobi i Quinlan Vos też muszą go znaleźć. Pościg przez bagna Nal Hutta prowadzi prześladowców do ogromnej matki Ziro, Mamy Hutt, która wskazuje im Teth. To tutaj, w tajnym grobie ojca Ziro, zbiegł Hutt ukrył dziennik. Kiedy go odzyskuje, Snooty ujawnia swoje prawdziwe miejsca. To śmiertelnie pogardzana kobieta i łowczyni nagród do wynajęcia!

Kiedy Senat rozpoczyna debatę nad ustawą, która wyeliminowałaby nadzór rządu nad działaniami klanu bankowego w celu sfinansowania wojny, Padmé i Ahsoka potajemnie podróżują do stolicy Konfederacji Niezależnych Systemów. Amidala próbuje zawrzeć porozumienie pokojowe z Separatystami, podczas gdy Ahsoka po raz pierwszy spotyka ludzi Konfederacji. Przyjaciółka Padmé, Mina Bonteri, stoi na czele inicjatywy pokojowej i przekonuje Kongres Separatystów, by wystąpił o pokój. W międzyczasie na Coruscant senatorowie Lott Dod i Gume Saam spiskują z przedstawicielem klanu bankowego Nix Card i hrabią Dooku, aby uczynić deregulację bankową rzeczywistością. Na rozkaz Dooku generał Grievous konstruuje atak na centralną sieć dystrybucji energii na Coruscant, przeprowadzony przez droidy demolujące Separatystów. Chaos i panika rozprzestrzeniają się po Senacie, który stanowczo odrzuca inicjatywę pokojową Separatystów.

Padmé, Bail Organa i Onaconda Farr próbują zmobilizować senatorów w opozycji do ustawy, która zapewniłaby fundusze milionom nowych żołnierzy klonów i miałaby katastrofalne konsekwencje finansowe dla Republiki. Jednak ich sprzeciw wobec tego środka szybko czyni z nich cele zastraszania i ataków z wynajętej broni. Po ucieczce dwóch wynajętych zbirów - Chaty Hyoki i Robonino - w przerażającym pościgu na ścigaczu, Padmé jest w stanie wpłynąć na Senat, opowiadając poruszającą relację o tym, jak wojna wpłynęła na zwykłego cywila, jej służącą Teckla Minnau.

Zaniepokojony rosnącą sprawnością Asajj Ventress w posługiwaniu się ciemną stroną Mocy, Darth Sidious nakazuje hrabiemu Dooku, by ją wyeliminował. Ale Ventress przeżywa próbę zamachu na Dooku, a porzucona była uczennica przysięga zemstę, werbując na pomoc jej krewnych - mistyczne Siostry Nocy - w swoim złowrogim planie. Matka Talzin, przywódczyni Sióstr Nocy, zasłania Asajja i innych zabójców płaszczem niewidzialności i infiltrują pałac Dooku na Serenno. Chociaż nie udało im się zabić hrabiego, ich użycie schwytanych mieczy świetlnych Jedi prowadzi Dooku do błędnego przekonania, że Jedi próbowali go zabić. Zainteresowany ochroną prosi Matkę Talzin o nową uczennicę.

Kiedy hrabia Dooku wzywa Siostry Nocy, szukając zastępstwa dla Ventress, ona i jej krewni korzystają z okazji, by dokonać zemsty. Ventress odwiedza odległe krańce Dathomir i samców planety w poszukiwaniu najbardziej brutalnego i potężnego wojownika spośród nich. Talzin każe Asajjowi potajemnie wybrać wojownika z odległej wioski Nightbrother: Savage Opress. Dzięki mocy czarnej magii Talzin przekształca Dzikiego w potężnego wojownika lojalnego wobec Asajja. Następnie dostarcza Opress do Dooku, gdzie będzie służył jako jego tajny uczeń Sithów w spisku mającym na celu obalenie Dartha Sidiousa.

Anakin i Obi-Wan, wysłani, by wytropić tajemniczą postać stojącą za śmiercią kilku Jedi, wkrótce trafiają na ślad potwornego ucznia, którego stworzyła Ventress: Dzikiego Opresanta, który został wyszkolony na drogach Sithów przez Dooku . Kiedy Opress wraca do hrabiego Dooku po nieudanym przydziale, Ventress uderza. Mając Opress u boku, atakuje Dooku. Lojalność Opressa jest jednak przelotna, a Dooku i Ventress odkrywają, że ten nowy uczeń ma własną wolę. Kiedy Savage wraca do Matki Talzin, daje mu nowe zadanie: poszukiwanie Zewnętrznych Rubieży dla jego dawno zaginionego brata ...

Tajemnicza siła przyciąga Anakina, Obi-Wana i Ahsokę na odległą planetę, a jej mieszkańców - rodzinę wyjątkowo potężnych dzierżących Moc - w celu ustalenia, czy Anakin jest naprawdę Wybranym. Patriarcha tej rodziny, znany tylko jako Ojciec, spędził wieki utrzymując równowagę między swoją Córką, która jest silna dzięki jasnej stronie Mocy, a swoim Synem, który jest zestrojony z ciemnością. Ojciec ujawnia, że jego dni są policzone i szuka Anakina, aby zajął jego miejsce jako punkt oparcia tej równowagi. Seria testów dowodzi, że Anakin jest w stanie kontrolować oboje potomstwo, tak jak robi to Ojciec, ale Skywalker odmawia zajęcia miejsca Ojca.

Zanim Jedi opuści Mortis, Syn bierze Ahsokę do niewoli, próbując zachęcić Anakina do przyłączenia się do niego i wykorzystania ich połączonej siły do pokonania jego Ojca i Siostry. W tym celu Syn rzuca Ahsokę pod urok Ciemnej Strony. W międzyczasie Ojciec próbuje powstrzymać katastrofalną rozgrywkę między swoimi dziećmi i utrzymać coraz bardziej niepewną równowagę Mocy na planecie. Obawiając się, że Syn może być niepowstrzymany, Córka robi to, co zabronione, zabierając Obi-Wana Kenobiego do Ołtarza Mortisa, gdzie jest przechowywany Sztylet Mortisa, broń zdolna do zabicia władającego Mocą. Syn kradnie broń i próbuje użyć jej przeciwko swojemu Ojcu, aby ukraść jego moc i zakończyć jego panowanie, ale Córka poświęca się, stawiając się przed ostrzem.

Jedi pozostają osieroceni na Mortis, a Syn, sprzymierzony z ciemną stroną Mocy, ponawia swoje wysiłki, by nawrócić Anakina, gdy Jedi przygotowują się do decydującej konfrontacji. Anakin jest oszołomiony obrazami swojej mrocznej przyszłości. Syn obiecuje mu moc odwrócenia tego przeznaczenia. Ojciec uznaje, że Syn złamał reguły czasu. Ociera pamięć Anakina o przyszłych wizjach i kradnie sztylet Mortisa, aby zakończyć konflikt. Ojciec przebija samego siebie, uniemożliwiając Synowi kradzież jego mocy. Oszołomiony tym Syn przebiega przez Anakina. Po zniszczeniu wszystkich trzech posiadaczy Mocy, brak równowagi w Mocy znika na Mortis. Trzej Jedi zostają przeszczepieni z powrotem do właściwej galaktyki, najwyraźniej w chwili, gdy zniknęli.

Z pomocą R2-D2 i oddziału schwytanych droidów bojowych, elitarny zespół Jedi i żołnierzy-klonów dowodzony przez Obi-Wana i Anakina próbuje uwolnić pojmanego generała Jedi, Even Piella, z nieprzeniknionego więzienia. Wbrew rozkazom Ahsoka Tano dołącza do niej, chociaż okazuje się niezbędna, gdy misja infiltracji zaczyna ewoluować. Piell i jego oficer floty, kapitan Tarkin, zostają wyzwoleni ze swoich cel, ale teraz zbiegowie muszą uciec z samej Cytadeli.

Z uwolnionymi więźniami w ich posiadaniu i brutalnym strażnikiem, który desperacko próbuje im przeszkodzić, Obi-Wan i Anakin szukają wyjścia z Cytadeli i powrotu na Coruscant. Więzienie ma jednak w zanadrzu więcej pułapek, niebezpieczeństw i pułapek, niż sobie wyobrażali, a jeśli chcą uciec, muszą pokonać swoje różnice. Ich próba wejścia na pokład wahadłowca kończy się niepowodzeniem, gdy ogień ciężkiej broni niszczy statek ratunkowy. Trooper Echo ginie w wybuchu. Uciekinierzy następnie uciekają do jaskiń i wzywają ratunek ze świątyni Jedi na Coruscant.

Po zniszczeniu ich statku i jedynej drogi od planety, Anakin i Obi-Wan muszą poprowadzić zbiegłych więźniów przez niebezpieczny krajobraz Loli Sayu, podczas gdy Plo Koon dowodzi oddziałem operacyjnym złożonym z czterech krążowników i ich myśliwców przez obronę Separatystów w śmiałym ratunku. Nawet Piell jest spustoszony przez tropiące bestie anooby, ale zanim umrze, przekazuje współrzędne swoich tras Nexusa do Ahsoki. Kiedy ci, którzy przeżyli, wracają na Coruscant, Ahsoka zna połowę danych wywiadowczych i odmawia ujawnienia ich nikomu poza Radą Jedi, podczas gdy Tarkin odmawia przekazania swojej połowy nikomu poza Chancello

Ahsoka i grupa uprowadzonych młodych ludzi zostają uwięzieni na księżycu Trandoshan, polując na wyszukane i okrutne polowanie. Porzucone młodziki straciły wszelką nadzieję, pomimo najlepszych wysiłków ich porywczego przywódcy, Kalify. Ahsoka zmusza ich do obrony i uderzenia przeciwko Trandoshanowi, co ma śmiertelne konsekwencje.

Ahsoka i jej młodzi sojusznicy usiłują uniknąć łowców Trandoshan, a ich wysiłki zyskują nieoczekiwany impuls, gdy przybywa nowy jeniec - Chewbacca Wookiee. Chewie wyciąga części z wraku statku niewolników Trandoshan, montując komunikator, aby wysłać sygnał alarmowy. Pomoc przybywa w potężnej, kudłatej postaci wojowników Wookiee dowodzonych przez generała Tarffula. Uwolniona z niewoli Ahsoka wraca do Świątyni Jedi i spotyka się z Anakinem Skywalkerem.

Kiedy król Mon Cala zostaje zamordowany, zrywają się rozmowy między ludem Mon Calamari a Quarren, współmieszkańcami podwodnego świata. Aby powstrzymać wojnę domową, Republika wysyła Padmé Amidala i Anakina Skywalkera, ale bez ich wiedzy, Quarren są już wspierani przez Separatystów. Teraz Jedi muszą chronić nowego przywódcę Mon Cala, młodego księcia Lee-Char, przed atakiem.

Anakin Skywalker i reszta jego drużyny Jedi zostali pokonani przez niespodziewane ataki Separatystów pod wodzą Riffa Tamsona, podczas gdy książę Lee-Char i Ahsoka muszą samodzielnie uniknąć schwytania. Niezdolny do wezwania większej pomocy Republiki, Yoda zwraca się o pomoc do potężnej i amfibijnej Wielkiej Armii Gungan, ale nie jest pewne, czy będą one wystarczające, aby powstrzymać oblężenie Separatystów. Wściekły Tamson podwaja swoje wysiłki w wytropieniu księcia Lee-Chara, uwalniając posiłki podane mu przez hrabiego Dooku podczas ataku, który burzy oceany.

Siły Republiki i Gungan zostały schwytane przez Riffa Tamsona i jego strażników z Karkarodon. Teraz to Ahsoka i młody książę Lee-Char muszą zjednoczyć podzieloną ludność Mon Cala i wypędzić najeźdźców Separatystów.

Kiedy przywódca Gunganów, Boss Lyonie, zostaje kontuzjowany, okazuje się, że istnieje niesamowite podobieństwo między Bossem a Jar Jar Binksem. Binks musi powstrzymać swój lud przed powstaniem przeciwko Naboo i powstrzymaniem inwazji Separatystów pod wodzą generała Grievousa.

Po tym, jak trzęsienia ziemi zdewastowały planetę Aleen, Republika rozpoczyna akcję ratunkową, w tym droidy R2-D2 i C-3PO. Kiedy prośby tubylczej Aleeny stają się niesłyszalne, obowiązkiem robotów staje się wyruszyć w surrealistyczną podróż przez podziemny świat Aleena, aby ocalić planetę.

Dziwaczny kaprys C-3PO i R2-D2 trwa. Zmuszone do ucieczki przed atakiem Separatystów myśliwcem Y-wing, droidy odwiedzają świat Patitites, dziwną planetę Balnab i wnętrze pirackiego okrętu wojennego, gdzie są zmuszone walczyć na arenie gladiatorów.

Kiedy Anakin jest zmuszony tymczasowo przekazać dowództwo nad swoimi żołnierzami-klonami nowemu dowódcy, Jedi Pong Krellowi, napięcie zaczyna rosnąć, ponieważ klony otrzymują bardzo zabójczą misję zdobycia stolicy Umbary.

Generał Krell nakazuje kapitanowi Rexowi i żołnierzom-klonom z 501. Legionu podbić silnie ufortyfikowaną bazę lotniczą Umbaran i nie uznają niczego innego niż zwycięstwo. To niemal pewna misja samobójcza, chyba że klony wykorzystają swoją pomysłowość, aby pokonać nowego wroga.

Po tym, jak Republika podbija bazę lotniczą Umbaran, generał Krell nakazuje Rexowi i jego ludziom udać się do silnie ufortyfikowanej stolicy. Zdając sobie sprawę, że istnieje lepszy plan, kilku żołnierzy-klonów sprzeciwia się rozkazom przeprowadzenia nielegalnej, tajnej operacji.

Kiedy dwóch jego ludzi grozi egzekucja za nieposłuszeństwo rozkazom, kapitan Rex musi stawić czoła swojemu nazbyt agresywnemu dowódcy, generałowi Krellowi. Ryzykując zarzutami buntu, Rex musi dokonać mrocznego wyboru, gdy pojawia się prawdziwa twarz wroga.

Zygerriańscy handlarze niewolników stoją za nagłym zniknięciem całej kolonii ludzi na planecie Kiros. Gdy Anakin i Ahsoka spieszą się, aby rozbroić serię bomb podłożonych przez łowców niewolników, Obi-Wan musi walczyć ze swoim imponującym przywódcą.

Aby zlokalizować zaginionych kolonistów, Anakin, Obi-Wan i Ahsoka idą pod przykrywką, aby zinfiltrować handlarzy niewolników na Zygerrii. Anakin zmaga się ze swoimi emocjami, gdy przebiegła królowa Zygerrii zmusza go do podjęcia wątpliwych działań w celu wypełnienia swojej misji.

Anakin próbuje przekonać królową Zygerrii, że ona również jest niewolnicą i pionkiem w złym spisku Separatystów. W międzyczasie Obi-Wan pracuje w obozach niewolników w Kadavo, ponura sytuacja, która staje się coraz bardziej ponura.

Konferencję pokojową między separatystami i delegatami Republiki przerywa Lux Bonteri, syn nieżyjącego już senatora Separatystów, który angażuje Ahsokę w swoje niebezpieczne poszukiwania sprawiedliwości za śmierć swojej matki.

Kiedy Jedi dowiadują się o spisku Separatystów, mającym na celu porwanie Kanclerza Palpatine'a, jeden z nich musi wejść głęboko w tajniki jako zatwardziały przestępca, aby wydobyć informacje od spiskowców.

Uciekając przez galaktykę z przestępcami zbiegami, przebrany Obi-Wan, Cad Bane i Moralo Eval są wytrwale ścigani przez Anakina i Ahsokę, którzy nie mają pojęcia, że ścigają swojego przyjaciela.

Przebrany Obi-Wan towarzyszy Cad Bane'owi i Moralo Evalowi do Serenno, gdzie zaciągają się do brutalnej rywalizacji z innymi łowcami nagród z całej galaktyki, aby ustalić, kto weźmie udział w spisku mającym na celu porwanie Kanclerza.

Kanclerz udaje się na Naboo, aby przewodniczyć publicznej ceremonii, strzeżonej przez Rycerzy Jedi. Dooku i jego łowcy nagród - w tym tajny Obi-Wan Kenobi - rozpoczynają plan porwania.

Hrabia Dooku jest zdeterminowany, by zemścić się na Siostrach Nocy z Dathomir po ich zdradzie. Generał Grievous przeprowadza totalny atak droidów przeciwko władającym magią czarownicom, a Matka Talzin i Asajj Ventress prowadzą obronę, mając do dyspozycji wszystkie mroczne moce.

Bezcelowa Asajj Ventress dołącza do zespołu łowców nagród pod wodzą młodego Boby Fetta. Na obcym świecie podejmują niebezpieczną, ale dochodową misję, która wystawia na próbę granice ich umiejętności i siłę postaci Asajja.

Mroczny wojownik Savage Opress wyrusza na poszukiwanie swojego dawno zaginionego brata. Czy Darth Maul naprawdę żył po ponad dziesięciu latach od jego makabrycznego przecięcia ostrza Obi-Wana Kenobiego? Dzikie wyprawy w głąb pokręconej planety, aby znaleźć wszystko, co stało się z upadłym Lordem Sithów.

Savage i Maul, teraz ponownie zjednoczeni, ścigają Obi-Wana Kenobiego w poszukiwaniu zemsty, a Rycerz Jedi zostaje zmuszony do zjednoczenia się z zaskakującym sojusznikiem, by bronić się przed śmiercionośnym rodzeństwem.

Napędzani zemstą i wściekłością, nowo zjednoczeni rodzeństwo Savage Opress i Darth Maul sieją terror i przemoc w całej galaktyce. Gdy bracia Sithowie siłą rekrutują Hondo Ohnakę i jego piratów, Obi-Wan Kenobi i Adi Gallia ścigają ich, co prowadzi do śmiertelnej konfrontacji.

Anakin, Obi-Wan, Ahsoka i Rex podróżują do Onderonu, świata kontrolowanego przez Separatystów. Tam będą szkolić grupę rebeliantów - w tym Lux Bonteri - do pomocy w odbiciu stolicy Iziz spod rządów dwulicowego króla.

Pod nadzorem Ahsoki rebelianci Onderonu infiltrują stolicę i przeprowadzają serię ataków na cele w całym mieście. Gdy król z sojuszem Separatystów znajduje się pod rosnącą presją, by uporać się z rosnącym buntem, rebelianci wybierają nowego przywódcę.

Po buntowniczej próbie uratowania prawdziwego króla Onderona, Ramsisa Dendupa, nieoczekiwany sojusznik występuje, aby powstrzymać egzekucję Dendupa i wesprzeć sprawę rebeliantów.

Gdy rewolta na pełną skalę wciąga Onderona, rebelianci zadają decydujący cios królowi planety, zorientowanemu na separatystów. Niestety dla rebeliantów takie zwycięstwo ma wysoką cenę.

Ahsoka eskortuje grupę młodych ludzi do Ilum, gdzie nauczą się od Yody i przejdą kluczowy rytuał przejścia: skonstruowanie swoich mieczy świetlnych. Borykają się zarówno z fizycznymi, jak i wewnętrznymi wyzwaniami, gdy stają przed niebezpiecznym zadaniem, które ich czeka.

Gdy młodzi wracają z Ilum z Ahsoką, ich statek zostaje zaatakowany przez gang piratów Hondo. Dzieci muszą używać pomysłowych i improwizowanych pułapek, aby udaremnić rozbójników.

Gdy Ahsoka zostaje schwytana przez piratów Hondo, młodzi współpracują, aby zinfiltrować jaskinię piratów, używając sprytu i odwagi, by oszukać Hondo Ohnakę i rozpocząć śmiałą akcję ratunkową.

Kiedy generał Grievous przypuszcza atak na pełną skalę na piracką bazę na Florrum, Ahsoka i młodzi ludzie walczą ramię w ramię z Hondo i jego piratami, aby odwrócić siły Separatystów.

R2-D2 jest częścią zespołu droidów Republiki wybranych do ważnej misji prowadzonej przez drobnego pułkownika Gascona w celu uzyskania modułu szyfrującego z pancernika Separatystów. Droidy muszą pokonać wiele trudnych przeszkód, aby odnieść sukces w tym kluczowym zadaniu.

Po tym, jak kometa uszkodzi ich wahadłowiec, R2-D2, pułkownik Gascon i inne droidy rozbijają się na odludnej planecie, gdzie muszą przedostać się przez oszałamiającą przestrzeń pustki, aby wykonać swoją misję.

W prawie pustym mieście R2-D2 i jego zespół znajdują komandosa-klona cierpiącego na amnezję.

R2-D2 i jego zespół muszą powstrzymać sabotowany krążownik Jedi przed zniszczeniem kluczowej konferencji Republiki.

Savage i Maul zawierają sojusz z Death Watch, aby zaatakować wspólnego wroga: Obi-Wana Kenobiego.

Wspierani przez przestępcze półświatki, Sith i Death Watch przypuszczają atak na Mandalore.

Używając Księżnej Satine jako przynęty, Darth Maul zwabia Obi-Wana w pułapkę.

Anakin i Ahsoka badają śmiertelny zamach bombowy w Świątyni Jedi.

Gdy wojsko Republiki przejmuje sprawę zamachu w świątyni, Ahsoka staje w sprzeczności z admirałem Tarkinem.

Zbieg Ahsoka ucieka w przestępcze głębiny Coruscant.

Przed sądem za morderstwo Ahsoka staje przed największym wyzwaniem.

Tup z żołnierzy-klonów zapada na tajemniczą chorobę psychiczną, która skutkuje szokującą śmiercią Mistrza Jedi. Nie będąc w stanie wyjaśnić swoich morderczych czynów, Tup zostaje uspokojony i odesłany do Kamino w celu zbadania. W międzyczasie Admirał Separatystów Trench informuje hrabiego Dooku o zdradzie i jest przekonany, że zabójstwo ma coś głębszego. Anakin Skywalker i ARC Trooper Fives towarzyszą Tupowi, ale ich podróż powrotna zostaje zaatakowana przez Separatystów.

W sterylnych laboratoriach Kamino, schorowany żołnierz klonów Tup i jego przyjaciel ARC Trooper Fives są poddawani kwarantannie w celu zbadania po szokującym zamordowaniu przez Tupa Mistrza Jedi. Z pomocą droida medycznego AZI-3, Piątka jest zdeterminowana, aby dotrzeć do sedna stanu Tupa i odkryć tajemnicę zakopaną głęboko w programie klonowania Republiki.

Ciało żołnierza-klona Tupa ma zostać przetransportowane na Coruscant, gdzie lekarze kanclerza Palpatine'a dokładnie je zbadają. ARC Trooper Fives łamie protokół i przeciwstawia się rozkazom szukania odpowiedzi i odkrywa, że w mózgach wszystkich żołnierzy-klonów ukryty jest organiczny konstrukt o nieznanym celu.

Piątki nadal starają się uzyskać odpowiedzi dotyczące tajemnicy skażenia klonów i zapewniają audiencję u Najwyższego Kanclerza Palpatine'a. Ale sytuacja szybko się załamuje, gdy Piątka zostaje oskarżona o atak na Kanclerza i musi on uciec w głąb miasta Coruscant, ścigany przez innych żołnierzy-klonów.

Przebywając na Scipio, by sfinansować misję miłosierdzia, Padmé Amidala zostaje wezwana przez starego przyjaciela, Rusha Clovisa, do pomocy w odkryciu korupcji w klanie bankowym. Muszą uniknąć łowcy nagród Embo, aby uciec z planety z obciążającymi informacjami.

Po powrocie na Coruscant Clovis - znany zdrajca Republiki - zawiera wątpliwą umowę, która stawia go na czele klanu bankowego. Rosnąca nieufność i nienawiść Anakina do Clovisa nadwyrężają jego związek z Padmé do granic wytrzymałości.

Umowa Rusha Clovisa z Separatystami przynosi odwrotny skutek i sprowadza wojnę do bankowego świata Scipio.

Spokojny świat Bardotta i jego mistyczne ścieżki są zagrożone przez starożytne proroctwo, a jego najważniejsi duchowi przywódcy zniknęli. Królowa Julia z Bardotta prosi o pomoc swojego najbardziej zaufanego przyjaciela w Senacie, Jar Jar Binksa. Uznając wagę duchowej równowagi Bardotty, Rada Jedi wysyła Mace'a Windu, aby towarzyszył Binksowi i prowadził dochodzenie.

Ukochana królowa Jara Jara Binksa z planety Bardotta została uprowadzona przez żądny krwi kult Frangawla, aby wypełnić mroczną i starożytną przepowiednię. Reprezentant Binks i Mistrz Jedi Windu muszą znaleźć zaginioną królową, zanim kult zyska na sile.

Misja Jedi znajduje miecz świetlny należący do dawno zmarłego mistrza Sifo-Dyasa, co skłoniło Yodę, Obi-Wana Kenobiego i Anakina Skywalkera do rozpoczęcia śledztwa w sprawie jego zniknięcia sprzed dekady. To skłania Dartha Sidiousa do nakazania Darthowi Tyranusowi, aby oczyścił wszelkie luźne cele, które mogą doprowadzić Jedi do odkrycia prawdy o spisku Sithów.

Yoda jest głęboko zaniepokojony, kiedy słyszy coś zza grobu: głos Qui-Gon Jinna. Wiedząc, że Jedi nie może zachować swojej tożsamości po śmierci, Rada Jedi zaczyna się martwić, że Yoda może zostać zepsuty przez wpływ Ciemnej Strony. Zdeterminowany, by znaleźć odpowiedzi, Yoda ucieka ze świątyni Jedi, by podążać za bezcielesnym głosem.

Pozwalając Mocy prowadzić go, Yoda wyrusza w podróż do serca galaktyki do starożytnego świata, który jest jednym ze źródeł Mocy i źródłem midichlorianów. Yoda przechodzi trudne próby prowadzone przez Pięć Kapłanek, tajemniczych władców Mocy, którzy skrywają sekret nieśmiertelności.

Po wielu wyczerpujących próbach, Yoda następnie podróżuje do starożytnego rodzinnego świata Sithów, Moraband, gdzie musi stawić czoła starożytnemu złu zdeterminowanemu, by rządzić galaktyką.

Kapitan Rex i Parszywa Zgraja infiltrują bazę wroga na Anaxes.

Anakin Skywalker, Rex i Parszywa Zgraja dokonują szokującego odkrycia.

Po udanej ucieczce Anakin Skywalker i klony bronią lokalnej wioski.

Anakin Skywalker i Parszywa Zgraja chcą zapewnić zwycięstwo Republice.

Ahsoka zaprzyjaźnia się z pilotką, ale musi powstrzymać droida.

Trace odkrywa, że transportuje przyprawę dla Syndykatu Pyke'ów.

Ahsoka i siostry Martez próbują uciec Pyke'om.

Ahsoka sprawia, że siostry są wolne i dokonuje niezwykłego odkrycia.

Anakin i Obi-Wan decydują, czy pomóc Ahsoce, czy ratować Palpatine'a.

Ahsoka i Republika walczą z Maulem na Mandalore.

Gdy Ahsoka przewozi Maula do Rady Jedi, pada Rozkaz 66.

Galaktyka jest w chaosie, a Ahsoka i Rex walczą o przetrwanie.